הסיבות לאפילפסיה אצל כלבים מרובות, כמו אצל בני האדם: חלקן קשורות ישירות למוח כמו: בעיות מולדות, דלקות, טראומה לראש, גידולים ועוד וחלקן קשור לפעילות הגוף כגון: כשל כבד או כליות (הגורם לעליית רעלים בגוף), חוסר בגלוקוז, מכת חום, שינויים חדים ברמות מינרלים, הרעלות ועוד.
כאשר לא מצליחים למצוא כל סיבה ראשונית לעוויתות, הן מוגדרות כאפילפסיה, ומחלה זו אינה נחשבת לנפוצה, אך גם אינה נדירה באוכלוסיית הכלבים.
למעשה, תופעת האפילפסיה נפוצה יותר בקרב הכלבים מאשר אצל החתולים, ונחשבת לשכיחה יותר אצל גזעי כלבים כמו גולדן רטריבר, רועה גרמני ועוד.