בית כנסת עין גנים אשר נמצא ברחוב עין גנים 23 פ"ת, הוא שריד חשוב שמקשר ומחבר עבר מפואר והירואי לחיינו אנו. הוא הוקם לטובת הציבור ושימש במשך 83 שנים את צרכי הדת והציבור באזור. ואולם בשל פגעי הזמן ואי רצון ומוכנות של העירייה לשפצו כבר עשרות בשנים הוא סובל מצבע מתקלף, טייח נופל ומצב שהולך ומורע. התקציבים שאושרו לשיפוצו לא עוברים ונתקעים בסחבת העירייה והמצב מתדרדר. מדובר בהזנחה של עיריית פתח תקוה ובושה שהיא עוטה בשל כך על המקום, על התושבים, המתפללים ועל עבר מפואר.
בשנת תרע"א (1911)מסרו חובבי ציון את החלקה שבה נבנה אחר כך בית הכנסת ובית הספר עין גנים למושב עין גנים וזאת לצרכים ציבוריים. בשנת 1930 בנה מושב עין גנים על החלקה הנ"ל בית ספר ובית עם אשר מאוחר יותר הוסב לבית הכנסת (בית הספר פעיל עד היום). במהלך השנים ועד לאיחודו של המושב עם פ"ת, תוחזקו ושופצו המבנים הללו - בית הספר ובית הכנסת ע"י המושבה. בשנת 1934 עם הקמת לשכות רשום המקרקעין נרשם כל הקומפלקס כגוש חלקה אחד ע"ש מוכתר עין גנים בנאמנות עבור תושבי עין גנים.
בשנת 1937 הוחלט לאחד את מושב עין גנים עם פתח תקוה. ועד המושב פנה לקרן הקיימת ובקש להעביר לבעלותם את כל הנכסים הצבוריים של המושב אולם עקב הזמן הקצר עד לאיחוד ודרישות מסויימות של הקרן הקיימת הדבר לא התבצע. בשנת 1962 שונה שם הבעלים בלשכת רישום המקרקעין לעיריית פתח תקוה וזאת לפי דרישתו של ראש העירייה דאז מר פנחס רשיש.
מאז ועד היום לא השקיעה העירייה ולו שקל אחד בבית הכנסת לעומת בית הספר שבו נעשים שיפוצים כל קיץ. בשנת 2010 פנה ועד בית הכנסת לעירייה שתשפץ ותתחזק את בית הכנסת אולם הבקשה נדחתה בקש. בישיבת מועצת העיר שהתקיימה בחודש ספטמבר 2010 הועברה החלטה (ביוזמתו של סגן ראש בעיר הרב אוריאל בוסו) על הקצאה של 250.000 שקלים לשיפוצו של המבנה מאחר שהמבנה הוכרז כמבנה לשימור. עד היום לא התקבל הכסף עקב הערמת קשיים מטעם מחלקות העירייה השונות ובסופו של דבר הכסף שעליו הוחלט לא הועבר וההליך טורפד. בעצם עולה כי בית הכנסת מגיש מזה שנתיים בקשות לתמיכה מן העירייה מקבל הודעות על אישור הבקשות ואולם הכסף באופן תמוה לא מועבר בפועל.
לסיכום, עולה כי עד העברת הקומפלקס לעירייה בשנת 1937 המושב הוא שדאג לאחזקתו ושיפוצו של בית הכנסת ושל בית הספר. ברגע שהקומפלקס הועבר לרשות העירייה הם נכנסו לנעלי המושב ולכן חלה עליהם החובה לדאוג לשיפוצו ואחזקתו של מבנה בית הכנסת כשם שהם דואגים לשיפוצו ואחזקתו של בית הספר. ואולם הדברים לא מתרחשים כך בפועל. ההזנחה והסחבת נמשכו עשרות בשנים בנושא של אישור השיפוץ. ומשאושר הצורך ושאושרו התקציבים הם לא מועברים. העיזבון וההזנחה בנושא בית הכנסת בעין גנים, כמו גם העובדה שהוא הופקר ע"י העירייה אף שהוא רשום בטאבו על שם העירייה הן בושה של עיריית פתח תקוה שאין עליה כפרה.