במקום המתין רכב פרטי שפעל בתיאום עם הפורעים ביידוי האבנים ובשלב מסוים נעצר הרכב על נתיב הנסיעה באמצע הציר, זאת במטרה להאט את מהירות נסיעתם של האוטובוסים ובכך לאפשר לפורעים ליידות אבנים לעברם. נוסעי הרכב השתתפו באופן פעיל ביידוי האבנים.
כתוצאה מזריקת האבנים, נגרם נזק רב למספר אוטובוסים ואף נפצעו מספר נוסעים באורח קל ונזקקו לטיפול רפואי.
מפקד מחוז ירושלים ניצב דורון תורג׳מן הטיל את החקירה על היחידה המרכזית של מחוז ירושלים והנחה להשקיע את כל המשאבים הנדרשים, במטרה לעצור את החשודים ולהביאם לדין, אך כאמור - חלק מהם לא נעצרו. מן המשטרה נמסר כי "ביחידה המרכזית של מחוז ירושלים ממשיכים בימים אלו בחקירת המקרה במטרה לאתר מעורבים נוספים בהפרת הסדר האלימה ולמצות עמם את הדין".
בסיוע מרכז השליטה של מחוז ירושלים שהכווין את הכוחות לעבר החשודים, נעצרו בתוך זמן קצר ע״י המשטרה שלושה חשודים, שני תושבי כפר עקב ושוהה בלתי חוקי תושב קלקיליה, שהועברו לחקירה בימ"ר ירושלים. בהמשך אותר כלי הרכב שסייע בידם במקום האירוע ונעצרו שני החשודים נוספים, בני משפחה תושבי ואדי ג'וז, שהועברו אף הם לחקירה.
מעצרם של חמשת החשודים הוארך בבית משפט לטובת מיצוי פעולות החקירה וביום חמישי האחרון הוגשה נגדם הצהרת תובע לקראת הגשת כתב אישום ע״י הפרקליטות.