שרה נתניהו הייתה מעורבת במינויו של יוסי כהן לראש המטה לביטחון לאומי - טוענת (יום ג', 11.7.22) הדס קליין בהמשך עדותה בתיק 1000. "כהן היה בקשר עם [ארנון] מילצ'ן. הוא היה מיועד למנכ"ל אחד המשרדים אבל רצה להיות ראש המל"ל. הוא דיבר כמה פעמים עם ארנון, והוא אמר שידבר עם נתניהו. ארנון התקשר אלי, אמר שדיבר עם נתניהו ושאספר ליוסי מה שרה אומרת עליו, שהיא אוהבת אותו. ארנון אמר שהוא דיבר עם הזוג נתניהו וזה סוכם. ואז הוא פגש את [ראש המוסד] תמיר פרדו, ואמר לו בשמחה שבני הזוג אישרו את המינוי. פרדו אמר: עשית דבר רע. ארנון נבהל ואמר שהוא יתקן את זה". קליין העלתה עניין זה כדוגמה לעומק קשריו של מילצ'ן עם נתניהו. "לארנון היה המון פעמים שהוא רוצה לשתף את נתניהו בסד זמנים, הרגע. ברוב המקרים הוא קיבל מענה, אלא אם כן היה קבינט או משהו דומה. הייתי מחייגת ללשכה ואומרת למזכירות שארנון צריך אותו דחוף לשתי דקות, ולרוב היו מעבירים אותנו. אם הוא היה בכנסת, היו אומרים לנו מי נמצא איתו ולפעמים היו מקשרים אותנו או שהיינו מתקשרים. אמרתי לארנון: יום אחד מישהו לא יאהב את זה ויזכור לך את זה. אל תעשה את זה, אלא אם כן זהו משהו דרמטי למדינת ישראל".