תחקיר ראשוני שנערך בצה"ל מלמד על הטרגדיה הענקית שהובילה לירי לעבר שלושת החטופים, ולמותם המידי של השלושה: יותם חיים, אלון (לולו) שמריז וסאמר טאללקה. עיקרו: במהלך פעילות כוחות צה"ל בשוג'עייה חשדו הלוחמים שמדובר במחבלים - למרות דגל לבן שהניפו, וירו בשניים מהם למוות; החטוף השלישי נמלט למבנה, וצעק "הצילו", אך למרות זאת הוא נורה למוות.
התחקיר נערך בפיקוד דרום בפיקוח של מפקד פיקוד דרום אלוף
ירון פינקלמן. הרמטכ"ל
הרצי הלוי ושר הביטחון
יואב גלנט עודכנו בכל שלבי התחקיר תוך עמידה על ביצוע תחקיר יסודי. התברר כי כוח לוחם צה"ל מגדוד 17 שהיה במבנה בן מספר קומות, שעמד בתצפית, זיהה לטענתו שלושה חשודים ללא חולצה. אחד מהם החזיק ביד דגל לבן (בד לבן על מקל). אך בשל החשש שמדובר ב"מלוכדת משיכה", צעק הלוחם והכריז בקשר "מחבלים". הלוחם ירה ופגע בשניים מהחטופים והם נהרגו במקום; החטוף השלישי נמלט למבנה. המג"ד יצא ודלק אחרי החטוף השלישי במטרה ליצור מגע. יחד עם לוחמים נוספים, המבנה כותר. המג"ד קרא לחטוף/לחשוד לצאת החוצה, אך למרות שהחטוף יצא וצעק בעברית: "הצילו", הוא נורה למוות על-ידי שלושה לוחמים.
רק לאחר שהרגו את החטוף השלישי ועצרו לבדוק, הבינו לוחמי צה"ל כי משהו לא תקין. או-אז הבינו כי מדובר כנראה בחטופים. בשלב זה הוזעקו כוחות נוספים. הגופות הוטסו מהשטח ונערכה בדיקה. תוך זמן קצר התחוור, למרבה התדהמה: מדובר בשלושה חטופים ישראלים, ששרדו בשטח, ונורו בניגוד להוראות - למרות שהניפו דגל לבן.
בתחקיר התברר עוד, כי יומיים קודם לכן התגלתה על קירותיו של מבנה - במרחק של כמה מאות מטרים מהתקרית, כתובת גרפיטי: SOS, וכן: "שלושה חטופים". התגלתה בנוסף הקריאה: "הצילו". אלא שהלוחמים חשדו כי מדובר ב"מלכודת משיכה", ולכן לא העלו על דעתם כי באזור מצויים חטופים, שהצליחו להימלט משובייהם. דובר צה"ל פרסם ביום שישי - בלי קשר לאירוע הטראגי הנ"ל, כי חמאס הטמין מלכודות לחיילי צה"ל. באחד הבתים הוצבו בובות וחוברו אליהן מכשירי סאונד עם קולות בעברית. הבובות שנועדו למשוך לחיילים, הכילו מטענים גדולים. באותו אזור הרגו חיילי צה"ל, בימים האחרונים, 34 מחבלים.