תפקיד "המוכתר" במדרג השלטוני עבר תהליך של מיסוד ונכלל בחוקים העות'מאניים משנת 1864 ו-1871. כראש הכפר, העיירה, הישוב או קבוצת השבטים, הוטל עליו מחד-גיסא לייצג את הקהילה והיישוב (יחד עם "מועצת הזקנים") בפני השלטון ומאידך-גיסא, ליישם את תביעות ודרישות השלטון והממשל באזור בכל הנוגע לפיקוח על היישוב או על הקהילה (בעיקר בסיוע לתשלום המיסים, בגיוס בני השבט או הקהילה לצבא ודיווח מדויק על הסדר הציבורי). המוכתר החדש נדרש לקבל הסמכה רשמית (בכתב) והיה זכאי תשלום משכורת. באמצעות המוכתר, ביקשו הטורקים לשמור על השקט הצבאי-חברתי בנגב ולהעמיק את נאמנות התושבים "לשער העליון".
על אף היותו פקיד בדרג נמוך, הטיל עליו השלטון לשמור על יחסי שכנות טובה עם השבטים האחרים ועם היישובים העבריים החדשים שהוקמו באזור; למנוע מעשי איבה, סכסוכים ואף מלחמה ביניהם ולארח בביתו כל זר שנקלע למקום. לאחר כיבוש ארץ ישראל בידי גנרל אדמונד אלנבי בשנת 1917, השאיר השלטון הצבאי והמנדט את תפקידי המוכתר כפי שהיה נהוג קודם לכן ואף הוסיף לו מטלות. בשנת 1908 תחת השלטון העות'מאני, מונה ניסים אלקיים למוכתר היהודי הראשון בנגב, בקהילה היהודית בעזה. כסוחר מכובד באזור וכמי שהתמצא היטב בשפת השבטים ותרבותם, עיצב אלקיים את תפקיד המוכתר כמבקש את ההבנה והכבוד ההדדי בין שתי הקהילות.
אישיותו סייעה לו לאתר עבור הקק"ל והכשרת היישוב קרקעות לרכישה בנגב הצפוני. דמותו ומעשיו השפיעו רבות על מוכתרי ההתיישבות היהודית החדשה בנגב. בשנת 1920, מינה מושל המחוז הבריטי את משה גורדון למוכתר היהודי הראשון בקהילה היהודית הקטנה בבאר-שבע. גורדון עמד על זכויות היהודים לבנות בית כנסת ולהתפלל בו, להוציא
עיתון בעברית, לזכות בהגנה על הנפש והרכוש מצד המושל הבריטי ולהיות מיוצגים באופן שווה לקהילה הערבית והנוצרית בכל האירועים הרשמיים.
בשנת 1939, עם עליית קיבוץ נגבה על הקרקע, מונה מיכאל הנגבי (קופיטבסקי) למוכתר הקיבוץ והיה למתווך בין הקיבוץ לבין הפקידות הבריטית בנגב. על המוכתר היהודי הוטל לנהל את פנקס המוכתר; לארח את נכבדי הבדואים וקציני הצבא הבריטיים ולדווח לפקידות בעזה על כל שינוי דמוגרפי שחל בקיבוצו. המוכתר קיבל חותמת מיוחדת, משכורת חודשית וכן אושר לו לשאת נשק באופן גלוי וחוקי. גם לגבי שבטי הבדואים נהגו הבריטים כשם שנהגו קודמיהם בשלטון. השיח', אמור היה למלא את רוב תפקידי המוכתר ואף תוגמל על כך ובדרך זו נמנעו הבריטים מלהתערב במסורת השבטית.