ישראל היא החשודה העיקרית בחיסולו של מאזן פוקהא. אולם, בחינת הכוחות בשטח מלמדת שהיא לא לבד. לאחר חיסולו של בכיר חיזבאללה חסן אל-לקיס, נטען שחיזבאללה עצמו עומד מאחורי החיסול לאחר שאל-לקיס נחשף כסוכן מוסד. השערה זו תקפה גם לגבי פוקהא, שנטען, כי הוא היה סוכן כפול של ישראל ויחיא סינוואר, ראש הזרוע הצבאית של החמאס ברצועה, הורה על חיסולו.
אפשרות אחרת היא, שהתנועה הסלפית ברצועה עומדת מאחורי החיסול. חמאס פעל בחודשים האחרונים נגד הפעילים הסלאפים ברצועה, ואף עצר את ירי הרקטות שלהם לעבר ישראל. לכן, ייתכן שהתנועה הסלפית רצתה לפגוע בחמאס, באמצעות התנקשות באחד מבכיריו. שתי אפשרויות נוספות, ששתיהן בסבירות נמוכה, היא שהרשות הפלשתינית עומדת מאחורי החיסול, או שחיסולו של פוקהא נבע מסכסוך על-רקע אישי ללא קשר לפעילותו בחמאס.