אחרי שנראה היה כי סיים את דרכו כשחקן פעיל, דורון שפר חוזר לפרקט.
השחקן, שזכה באליפות היסטורית עם הגליל, שיחק בהצלחה במכללת קונטיקט, לקח אליפויות עם מכבי וזכה בגביע היול"ב עם הפועל ירושלים, יישחק בעונה הבאה בגליל עליון (חתם לעונה אחת), אותה מאמן אלי קנטי.
יו"ר הגליל, יעקב קוז'יקרו, אישר את הידיעה ל-ONE.
חיים אוחיון, הבעלים של הפועל גליל-עליון, אמר מוקדם יותר היום: "אנחנו קבוצה של הזדמנויות. אנחנו נדע לקחת את ההזדמנות שתעשיר ותאשיר אותנו מבחינת כל הצדדים. יש פה סימליות מסויימת, אבל יש גם עניינים אופרטיביים".
אוחיון הוסיף: "כולנו כאן למטרה אחת - לשחק כדורסל, להגיע להישגים ולהצליח. זה אומר להתאמן בלי הנחות, כל אחד יעשה את זה בדרכו שלו עם השקעה".
הבעלים של הגליל הוסיף: "אין ויכוח על הסימליות, דורון שפר שיחק כאן שלוש שנים והצליח בצורה מיוחדת במינה. כאן בגליל יש לנו אוויר אחר. יש לנו הרבה זמן לחשוב, אנחנו ידועים ביצירתיות שלנו, ככה גם הבאנו את עודד קטש וכך גם אלי קנטי חזר למפה כמאמן הפועל גליל-עליון.
"הכל כרוך בעבודה קשה, בהשקעה ובאמונה - אני התרשמתי מדורון שהוא בחור רוחני. גם הוא יודע וגם אנחנו יודעים שבסופו של דבר צריך לעבוד קשה בכדורסל כדי להצליח".
תחילת הקריירה
דורון שפר שיחק בצעירותו במ.ס רמת אפעל (שם גדל) ובהפועל גבעתיים. את הפריצה הגדולה עשה במדי הפועל גליל עליון בה שיחק בין השנים 1990 ו-1993.
בעונת 1992/3 עשה את הבלתי יאומן כאשר זכה באליפות עם פיני גרשון, על חשבונה של מכבי ת"א. שפר נתן עונה מדהימה ונבחר לשחקן העונה, לאחר תצוגות כדורסל מרשימות ובהן מספר משחקים שבהם קלע מעל ל-30 נקודות.
למי שהספיק לשכוח, באותה עונה הגליל הדיחה את מכבי ת"א כבר בסדרת חצי גמר הפלייאוף, כאשר אחת הסיבות העיקריות לאי ההצלחה של הצהובים היתה פציעתו של גיא גודס עוד בתחילת אותה עונה (את דייויד אנקראם אתם זוכרים?).
בסדרת הגמר פגשה הגליל את הפועל ת"א שכללה בין השאר את דייויד ת'רדקיל, וחגגה בסיום עם הקצפת והדובדבנים המוכרים של פיני גרשון.
ההצלחה בקונטיקט
ב-1993 עבר שפר לשחק במכללת קונטיקט בארצות הברית, שם זכה לכינוי החיבה "אייס-מן" (איש הקרח) בשל קור רוחו. הקבוצה זכתה שלוש שנים ברציפות באליפות ה"ביג-איסט".
בעונתו הראשונה זכה שפר בתואר "רוקי השנה". ב-1996 היה לשחקן הישראלי הראשון שנבחר בדראפט לליגת ה-NBA על-ידי קבוצת לוס אנגל'ס קליפרס בסיבוב שני - בחירה מס' 36.
בחזרה לארץ - למכבי ת"א
למרות שנבחר בדראפט לא חתם שפר על חוזה ועבר לשחק במכבי תל אביב. עם מכבי ת"א זכה שפר בארבע אליפויות, והיה לחלק מצמד הגארדים שכונה "קטשפר", יחד עם עודד קטש.
בשנת 2000 הודיע על פרישתו מעולם הכדורסל. מספר שנים מאוחר יותר התבררה הסיבה - שפר לקה במחלת הסרטן, אך הצליח להתגבר עליה. לאחר שלוש שנים, מסע להודו ופנייה לכיוון רוחני, חזר למכבי תל אביב, אך לא זכה לדקות משחק רבות, ולא הגיע להישגים מרשימים.
זכיה ביול"ב קאפ עם הפועל ירושלים
ב-2003 עבר שפר לשחק בהפועל ירושלים ויחד עם המאמן שרון דרוקר ושחקנים בדמותם של וויל סולומון וטנג'י אווג'ובי הוביל את ירושלים לזכיה היסטורית בגביע יול"ב.
בשנת 2004 המשיך שפר בירושלים, ואף מונה לקפטן, אך כמו יתר הקבוצה, לא זכה לשחזר את יכולתו מן העונה הקודמת.
הפרישה
ב-21 ביולי 2005 חתם לעונה אחת בהפועל תל אביב. באוקטובר באותה שנה הודיע, בפעם השנייה, על פרישתו מכדורסל. ב-27 בדצמבר 2005 הודיע דורון שפר על חזרתו לכדורסל, לקבוצת הפועל תל אביב, וחתם על חוזה עד תום העונה.
בנוסף להיותו שחקן, לקח על עצמו תפקיד של מנהל טכני בהנהלת הפועל ת"א. במסגרת התפקיד הצהיר כי יפעל לגיוס משקיעים, ולפתרון המשבר שנוצר בין האוהדים להנהלה, בין היתר בשל החלטת העיריה להרוס את אולם אוסישקין. אך כעבור זמן קצר חזר בו, והחליט לפרוש מעולם הכדורסל - בפעם השלישית.