הבעיה האסטרטגית אינה מתמצית בתחום הצבאי הטהור אלא בהבנת התהליכים המתרחשים באזורנו, ובמשמעות האיומים והסיכונים הנגזרים מהם לקיומה של מדינת ישראל. למדינת ישראל, על דעת הוגי-דעות צבאיים ומתוך מחקרים שפורסמו, אין מדיניות ביטחון לאומית והיא מנהלת את ענייניה החיוניים באמצעות המצאה ישראלית מקורית של "תורה שבעל-פה" הקרויה "תפישת הביטחון של ישראל", תפישה אשר מקורותיה מצויים אי-שם בלקחי מלחמת השחרור כפי שגובשו על
דוד בן-גוריון, יגאל אלון, יגאל ידין, משה דיין ואחרים. תפישה זו, שהותאמה לתקופה שעד למלחמת ששת הימים, התמקדה בשיטת ההפעלה של הכוח הצבאי, ולא במדיניות הביטחון הלאומי בראייה הכוללת שלו, קרי במאזן שבין הכושר הכולל של העמידה הלאומית לעומת כושר המחץ הצבאי של אומה המצויה במצב מלחמה מתמשך (ביטחון לאומי - מעטים מול רבים, ישראל טל, דביר 1996; יגאל אלון - מסך של חול, הקבוץ המאוחד, 1966).
היעדרה של מדיניות ביטחון לאומי עולה מעת לעת בסדר היום הציבורי, כגון בפרסומים: אסטרטגיה רבתי לישראל של הפרופסור יחזקאל דרור (אקדמון 1989), קללת הכלים השלובים של הד"ר עמנואל ולד (שוקן 1987) וכן במחקרים של ד"ר עמיר בר אור מהאוניברסיטה העברית בירושלים בנושא סוגיות עקרוניות במדיניות ביטחון לאומי בישראל, וכן ב
עבודת-מחקר של אבנר שמחוני: עומק אסטרטגי והחזית המזרחית – אוני' ת"א (יוני 2006).
היעדר מדיניות ביטחון כוללת מצד אחד, ומנגד - קיבעון מחשבתי הנצמד לתפישת הביטחון המסורתית, כבר הניבו כשלים מדיניים וצבאיים במלחמת יום הכיפורים, ובמיוחד מאי-לימוד הלקחים ברמת האסטרטגיה-רבתי של הביטחון הלאומי במלחמת לבנון הראשונה, האינתיפאדה הראשונה, מלחמת המפרץ הראשונה, טרור אוסלו והאינתיפאדה השנייה, ההינתקות, מלחמת לבנון השנייה והמערכות ה"קטנות" של
עופרת יצוקה והמשט הטורקי. בתקופה התדרדר כושר ההכרעה וההרתעה של צה"ל, וישראל עומדת במצב אסטרטגי נחות ומאוימת באופן חסר-תקדים בנשק טילי רב-עוצמה המכוון לאזרחיה ולמתקניה הצבאיים בלא הבדל.
כשלים אלה לא הניבו על-ידי כל ממשלות ישראל לדורותיהן ולו מסמך סדור אחד של מדיניות הביטחון הלאומי בכל טווח זמן, מיידי או עתידי, ומנגד - מאז פרסום הספר אסטרטגיה רבתי לישראל של יחזקאל דרור, לא העמיקה האקדמיה ישראלית לעסוק במחקר-יסוד זה, ולא פיתחה על בסיסו מתודולוגיה מחקרית עדכנית, או חשיבה חדשנית פורצת-גבולות לצרכים פרקטיים אשר ישמשו כמודל וכקו מנחה (Guideline) להגדרה ולניהול של מדיניות הביטחון הלאומי ממשלות ישראל.
גם הקמת המועצה לביטחון לאומי בהחלטת ממשלה 4889 ממרס 1999, לא יצרה מטה שייתן מענה ראוי ואפקטיבי לסוגיות הביטחון הלאומי, ומעמדו של גוף זה מול אמ"ן, כמעריך המודיעין הלאומי של ישראל, ומול המטכ"ל, המוסד והשב"כ, נשחק בהתמדה.
ביולי 2008 התקבל בכנסת חוק המטה לביטחון לאומי, התשס"ח 2008, המסדיר בחקיקה את מעמד המל"ל כגוף מטה של ראש הממשלה ושל הממשלה לענייני הביטחון הלאומי. בתוך כך שונה שמו של גוף זה מ"מועצה לביטחון לאומי" ל"מטה לביטחון לאומי", כשהקבינט המדיני-ביטחוני מהווה את הגוף של המועצה לביטחון לאומי.
ציפיות יוזמי החוק היו שהמטה לביטחון לאומי ישפר את תהליכי קבלת ההחלטות בנושאי חוץ וביטחון, ויצור שינוי אסטרטגי בסדר גודל משמעותי בעבודת הממשלה - לא התממשו. ביקורת
מבקר המדינה בכל הנוגע לתפקוד המל"ל לפני ואחרי מלחמת לבנון השנייה הוכיחה שגוף זה לא ערוך גם כיום לספק את התפוקות האינטלקטואליות הנדרשות בחוק מהמטה לביטחון לאומי.
התוצאה היא מערכת מדינית ביטחונית המתנהלת בתרבות ארגונית אינטואיטיבית אנטי-אינטלקטואלית הנסמכת על ניסיון ללא הכשרה מקצועית וללא מתודולוגיה ארגונית של נושאי תפקידי מפתח בארגון זה.
אריאל שרון הפך בימיו את המל"ל לגוף המתכנן של ההינתקות בלא שזה יגיש ניירות עמדה בסוגיות הביטחוניות שמהלך זה הוביל בעקבותיו, וללא ניהול כנדרש של תוכנית סיכונים וחלופות למקרה של אי-עמידה ביעדי התוכנית. התוצאה הייתה: אי-מוכנות צה"ל למלחמה שנה מאוחר יותר, חדירה של השפעה אירנית ומתן מימון לטרור של החמאס ברצועת עזה, חטיפת גלעד שליט, חטיפת החיילים בלבנון, מלחמת לבנון השנייה, אי-עמידה בלחץ אמריקני בשאלת הבחירות ברשות הפלשתינית, שתוצאתו הייתה השתלטות החמאס על הרצועה, התגברות הירי המסיבי של טילים ופצמ"רים מהרצועה לשטח ישראל, כישלון מבצע 'עופרת יצוקה' בלא השגת מטרות המבצע, ולו רק שחרורו של החייל החטוף, ובעיקר - המשמעות האסטרטגית של דוח גולדסטון על יכולתו המבצעית של צה"ל לעתיד לבוא, וכמובן הצורה הרשלנית בה תוכנן מבצע חסימת המשט הטורקי, כשהשגת יעדי הקרב והניצחון שהושג למדינת ישראל באה רק בשל איכות הכוח הלוחם, נחישותו ומקצועיותו.
כל אלה הם פועל-יוצא של מערכת מדינית וביטחונית הבנויה מטלאים של תפישות צבאיות, ודוגמות מדיניות שחוקות, מאולתרות ואנטי-אינטלקטואליות בעליל. בשיטה זו, כל מה שיורה או שנמצא תחת חסותו של הגוף הצבאי – צה"ל - זוכה למימון ולהתייחסות, בעוד נושאי הסברה ותקשורת המונים ברשתות המשודרות והחברתיות ברחבי העולם נעשים בשיטות ובזמני תגובה המתאימים אולי לראשית המאה הקודמת. הסברה בישראל הפכה לנושא המזכיר את מזג האוויר – כולם דנים בו, אך איש לא עושה דבר לשנותו, ודווקא באומה היהודית שהוציאה מתוכה את טובי הוגי-הדעות, הסופרים, אנשי-העט, ועיתונאים ממיטב מומחי התקשורת וההסברה בעולם - לא נמצא גוף שיילחם בהסתה הג'נוסיידית הרצחנית הקוראת להשמדת מדינת ישראל. דומה שמתוך אלה בולטים דווקא מרעילי הבארות וחוצי-הקווים בקרב העם היהודי – בוגדים נחרצים העושים ככל שלאל ידם לפגוע בדמותה של המדינה היהודית.