כפי שעולה מטענות החוקרים, החשוד המרכזי בפרשה הוא בעל האתר, שלגביו נטען כי גילה את הפוטנציאל הכלכלי הגלום בפחדם של החרדים מפני פרסום שלילי. בין הנחקרים בפרשה נקרא למסור עדות גם עורך החדשות הראשי באתר, אך זה שוחרר לביתו עוד באותו היום. בעדותו מסר עורך החדשות שמעולם לא ידע על האיומים המופנים כלפי אישים שונים. הוא הודה שקיבל מעת לעת הוראות מפורשות "להוריד כתבות", אך כאשר שאל למה תירצו זאת באוזניו בטענה של קשרים חברתיים.
בבית המשפט השבוע טענו חוקרי המשטרה: "בעל האתר היה נפגש עם הקורבן ומסביר לו בדרך אסרטיבית מאוד שהאשכול (שרשור הודעות בפורום) לא יכול לרדת, אבל הוא רואה את הדברים בהסתכלות רחבה יותר ובפרספקטיבה פרסומית. מי שהיה בר-מזל הצליח להגיע למנהלי האתר ושילם רק כמה אלפי שקלים תמורת הורדת תכנים. מי שהיה חסר מזל קצת יותר, נדרש לשלם הרבה יותר. כהן הסווה את 'הפעילות העסקית' בייעוץ פרסומי לפרסום כתבות חיוביות, גם אם לאדם או לגוף מסוים לא היה צורך בפרסום. אמרו לו: 'אז תפרסם סופגניות', והוא נאלץ לפרסם באתר בסכומים אדירים. לאחד העדים, המנהל שני תלמודי תורה, אמרו: נפרסם לך את תלמודי התורה. הוא לא רצה לפרסם אבל הכריחו אותו לפרסם. מה זה, טיטולים? מצנחי רחיפה? למה תלמוד תורה צריך פרסום?"
החקירה בעניין 'בחדרי חרדים' מתנהלת כבר כמה חודשים באופן סמוי. השבוע, לאחר המעצרים המתוקשרים, מיהרו במשטרה לזמן לחדרי החקירות שורה ארוכה של עדים ואלה סיפקו עדויות מצמררות. חוקר המשטרה סיפר לשופטת: "אחד העדים רעד, התחנן 'אל תגבו ממני עדות', הבנאדם (בעל האתר) יכול להרוג אותי. לא פיזית, אלא באתר. הם מפחדים ממנו. אותו עד מת מפחד. יש בידינו הודאות של קורבנות שהחיים שלהם השתבשו לחלוטין מרגע שהכתבות פורסמו".
עד לאחרונה כוונת המשטרה הייתה להמתין לפני המעבר לחקירה גלויה, אלא שבחודש האחרון הגיעה אליהם עדות על ניסיון לסחיטה באיומים בזמן אמת. מדובר בעדותו של יענקי ברגר, עסקן חרדי שדיווח למשטרה שבתגובה לדרישתו להוריד כתבה לא מחמיאה על אודותיו מהאתר, התנו אישים באתר 'בחדרי חרדים' את הסרתה ברכישת פרסום בסכום כסף גדול. העדות הזו הכניסה את חוקרי המשטרה למהלך של פעילות מוגברת. ברגר זימן נציג של האתר לפגישה שתועדה באמצעות מצלמה נסתרת, שלטענת המשטרה מהווה הוכחה ניצחת לבית המשפט בשאלה "איך העסק עובד". בסרט, שעלה מאז כמעט בכל אתרי האינטרנט, אפשר לראות ולשמוע את איש האתר מספר לעסקן החרדי שהוא יכול להכניס אותו לרשימה סגורה של פוליטיקאים ואנשי עסקים, ושהוא עושה לו טובה שהוא נמצא ברף התחתון של הרשימה, אלו שמשלמים רק עשרת אלפים דולר בחודש במשך שנה, משום שהגדולים משלמים הרבה יותר.