בעקבות הפרות של היתר פליטה ושל חוק אוויר נקי, המשרד להגנת הסביבה הוציא צו מנהלי לנשר מפעלי מלט ישראליים, המורה על מניעה או צמצום של זיהום אוויר לפי סעיף 45 לחוק אוויר נקי. במסגרת הצו, הורה המשרד להגנת הסביבה למפעל נשר להפסיק את כלל הפעולות הגורמות לזיהום אוויר מהמפעל ולפעול בכל האמצעים הדרושים למניעתו או לצמצמו של זיהום האוויר שעלול להיגרם. המשרד ימשיך לעקוב אחרי ביצוע דרישותיו.