ח"כ סון הר-מלך פתחה את הדיון בטענה כי ארגון הבריאות העולמי הפך לכלי פוליטי המשמש להפעלת לחצים על ישראל, תוך התעלמות מוחלטת מהתנהלות חמאס בעזה ושימושו בבתי חולים כמוקדי טרור. היא טענה כי קיימת התנהגות חד-צדדית של הארגון, תוך פרסום גינויים חוזרים ונשנים נגד ישראל והימנעות מהוקעת פשעי חמאס.

לדבריה הצטרפו חברי הכנסת גלית דיסטל-אטבריאן, ניסים ואטורי, אושר שקלים ומיכל וולדיגר, אשר טענו כי על ישראל ללכת בעקבות ארצות הברית ולפרוש מהארגון. ח"כ קלנר ציין כי פרישה מהארגון תאפשר לישראל לשלוט במדיניות הבריאות שלה באופן עצמאי ולחזק את שיתופי הפעולה הישירים עם מדינות ידידותיות. במהלך הדיון הוצגו נתונים המעידים על מדיניות אנטי-ישראלית לכאורה מצד הארגון, ביניהם גינויים שפורסמו בעשור האחרון נגד ישראל תוך התעלמות מהשימוש של חמאס במתקני רפואה לצורכי טרור, וכן החלטות חד-צדדיות שגינו את ישראל על פגיעות בבתי חולים בעזה.

מנגד, נציגי ההסתדרות הרפואית וחוקרים בכירים הזהירו מפני השלכות קשות של יציאה מהארגון. הפרופסור דורית ניצן, נציגת ההסתדרות הרפואית ולשעבר בכירה בארגון, טענה כי פרישה תבודד את ישראל מהקהילה הרפואית העולמית, תפגע בגישה לחיסונים ולמחקרים בינלאומיים, ותקטין את יכולתה של המדינה להתמודד עם איומי מגפות. לטענתה, החברות בארגון מאפשרת לישראל להשתתף בקביעת תקני רפואה בינלאומיים ולגשת למחקרים מתקדמים. בנוסף, הארגון מספק התראות מוקדמות על מגפות ותמיכה טכנולוגית לרופאים, לצד סיוע בהעברת ציוד רפואי ותרופות בעתות חירום. הד"ר אשר שלמון, ראש אגף בינלאומי במשרד הבריאות שלאחרונה נבחר כחבר הוועד המנהל של ארגון הבריאות העולמי, הדגיש כי יציאה מהארגון תצמצם משמעותית את יכולתה של ישראל להשתתף בעיצוב המדיניות הרפואית העולמית ותפגע במעמדה הדיפלומטי. לאחר הדיון הפומבי, הוחלט כי לפי שעה אין צורך לקיים דיון חסוי, כפי שתוכנן תחילה, שבו יידונו פרטים רגישים הקשורים להסכמים בין משרד הבריאות לבין ארגון הבריאות העולמי, וכן מידע מסווג על תקנות בינלאומיות חדשות שעלולות להשפיע על ריבונות ישראל בתחום הבריאות, וימתינו להתפתחויות בנושר.

אחת הסוגיות המרכזיות הייתה התחייבויות עתידיות שעלולות לכבול את ישראל להחלטות בינלאומיות במצבי חירום רפואיים. כמו-כן, נדונה האפשרות שישראל תחויב לשתף מידע רפואי רגיש עם גורמים חיצוניים כחלק מהאמנות החדשות. ח"כ סון הר-מלך טענה כי לציבור מגיע לדעת אילו התחייבויות משרד הבריאות נוטל על עצמו בשם המדינה. מנגד, נציגי משרד הבריאות טענו כי מדובר בנושאים רגישים הנוגעים לביטחון הלאומי והבריאותי של ישראל. לאחר דיון ממושך, הוחלט לקיים דיון נוסף בהשתתפות נציגי משרדי הממשלה, על-מנת לבחון את המשמעויות המשפטיות, הבריאותיות והכלכליות של פרישה אפשרית מהארגון. ח"כ סון הר-מלך סיכמה כי הגיע הזמן שמדינת ישראל תפסיק להיות תלויה בארגונים גלובליים שמקבלים החלטות ממניעים פוליטיים וכי על המדינה לשמור על ריבונותה ולקבל את ההחלטות הרפואיות שלה בעצמה. בעוד שהלחץ לפרוש מהארגון גובר, החלטה סופית טרם התקבלה. בקרוב ייערך דיון נוסף, שצפוי לכלול את עמדת משרד הבריאות, משרד החוץ ונציגים נוספים ממערכת הבריאות הישראלית. השאלה המרכזית היא האם התועלת שבחברות בארגון עולה על המחיר, או שמדובר בגוף שמזיק לאינטרסים של ישראל.