במשרד החינוך התקבלו במהלך השנה כ-40 תלונות בשל הפעלת שעת אפס בניגוד לנוהל. במשרד מדגישים כי אין להפעיל שעות אפס אלא אם ניתן אישור מיוחד מטעם מנהל המחוז. 18 בתי ספר בלבד קיבלו את האישור להנהגת שעת אפס בשל הסעות ומרחקים גיאוגרפיים.
מנכ"ל משרד החינוך, שמאול אבואב, אמר בנושא כי "המשרד מתייחס בחומרה להפרת הנוהל של אי קיום שעת אפס", והדגיש, כי "במידה שיתקבלו תלונות בעניין הנהגת שעת אפס, הנושא יטופל באופן מיידי על-ידי המחוז, עד לבירור אישי מול מנהל בית הספר".
אבואב הוסיף, כי מחקרים שנעשו בעולם בתחום השינה והשפעתה על איכות הלמידה, מצביעים על זיקה בין השניים, שכן למשך השינה ואיכותה השפעה קריטית על הפעילות הקוגניטיבית של התלמיד. בהתאם לממצאי המחקר, גיבש המשרד מדיניות, לפיה אין לקיים שעות אפס. במקרים חריגים ומנומקים, יאפשר המשרד, במסורה, קיומן של שעות אפס, ובלבד שהדבר יהיה מלווה באישור של מנהל מחוז.