צה"ל נאלץ לראשונה מזה שנים רבות להשתמש במסוקי "אפאצ'י" כדי להרחיק, באמצעות ירי, מחבלים חמושים מזירת הקרב בעיר ג'נין כדי לסייע ליציאת כוחות צה"ל מהעיר לאחר שעצרו מחבלים מבוקשים. הטרור הפלשתיני גובר והאירועים בשטח הופכים לאלימים יותר כפי שהיה בתקופת האינתיפאדה השנייה.
תופעה חדשה המזכירה את ימי האינתיפאדה השנייה היא השימוש הגובר של קבוצות הטרור הפלשתיניות במטעני חבלה גדולים נגד כוחות צה"ל. גורמי ביטחון בכירים מזהירים כי קבוצות הטרור מנסות לאתר את נקודות התורפה של צה"ל בפעילות בשטח ומתמקדות בניסיון לפגוע בכוחות צה"ל בעת הכניסה והיציאה של כוחות צה"ל למרכזי הערים ומחנות הפלשתינים בשטחי A באמצעות מטעני חבלה גדולים שמוטמנים על צירי התנועה. הכוונה היא לפגוע בחופש הפעולה של צה"ל, להגביר את ההרתעה ולגרום למספר נפגעים גבוה בקרב חיילי צה"ל.
קבוצות הטרור הפלשתיניות מנסות לחקות את שיטות הפעולה של חיזבאללה בלבנון, בשטח עצמו קמו מעבדות חבלה שמייצרות מטעני חבלה גדולים להפעלה נגד כלי הרכב הממוגנים של צה"ל. מטען החבלה הגדול שהופעל נגד כלי רכב של צה"ל בעיר ג'נין ב-19 ביוני גרם לפציעה של 7 חיילים. מדובר במטען חבלה גדול של יותר מ-20 ק"ג חומר נפץ שהופעל מרחוק באמצעות טלפון סלולרי. החשש בצה"ל הוא שארגוני הטרור יגבירו את השימוש במטעני החבלה ויניחו אותם גם בצירי התנועה הראשיים בצפון השומרון.
התופעה החדשה מחייבת את צה"ל והשב"כ להיערך בהתאם, לאסוף מודיעין מדויק על מעבדות החבלה שמכינות את המטענים, לאתר במדויק את מקומות הטמנת המטענים ולנטרל אותם. גורם ביטחוני מעריך כי אם הדרג המדיני לא יאשר בקרוב מבצע צבאי נרחב בצפון השומרון נגד קבוצות הטרור החמושות הוא יאשר פעילות צבאית נגד המעבדות לייצור מטעני חבלה שהוקמו בשטח כדי לצמצם את הסכנה לפגיעה בחיילי צה"ל ובמתיישבים היהודים.
על-פי ההערכות של גורמי הביטחון של ישראל, בצפון השומרון פועלים כבר בין 1000 ל-2000 מחבלים חמושים המשתייכים לג'יהאד האיסלאמי, חמאס ופתח. בעת המבצע של כוחות צה"ל השבוע בעיר ג'נין, ביקרו בטהרן שתי משלחות בכירות של חמאס והג'יהאד האיסלאמי ונפגשו עם ההנהגה האירנית וקצינים בכירים ב"משמרות המהפכה". הן דנו בהפקת לקחים ממבצע "מגן וחץ" של צה"ל נגד הג'יהאד האיסלאמי ברצועת עזה והידוק שיתוף הפעולה לקראת מערכה מאוחדת נגד ישראל מכמה חזיתות במקביל.
אירן מעודדת מהצלחת פעילות הטרור בצפון השומרון ועל-פי גורמים בחמאס בכירים ב"משמרות המהפכה" הבטיחו להמשיך להזרים כלי נשק וכספים לקבוצות הטרור ביהודה ושומרון באמצעות הברחות משטח ירדן. זיאד אלנח'אלה, מזכ"ל הג'יהאד האיסלאמי, אמר כי הפעילות של אנשיו נגד כוחות צה"ל בעיר ג'נין השבוע היא בעלת חשיבות גדולה, הוא שיבח את הפגיעה בכוחות צה"ל באמצעות מטען החבלה ואמר כי המורל של האויב הישראלי נפגע. צה"ל הצליח בחודשים האחרונים לבצע פעילות סיכול טרור מוצלחת ביהודה ושומרון כמעט ללא נפגעים ולהרוג ולעצור עשרות מחבלים חמושים. רמת הלחימה של חיילי צה"ל היא גבוהה ביותר בתנאי שטח קשים ובלב השטח הבנוי בהסתמך על מודיעין מדויק. לכן ארגוני הטרור פועלים לאתר דרכים חדשות כדי לעצור את פעילות צה"ל, הם מנסים להשיג יתרון איכותי על פני חיילי צה"ל ולהמציא שיטות טרור חדשות.
בצה"ל ובשב"כ מבינים כעת את האסטרטגיה החדשה של קבוצות הטרור וגורמי הביטחון יתמקדו בימים הקרובים בפעילות נגד מעבדות החבלה ביהודה ושומרון, אולם בסופו של דבר, למרות הלחץ המדיני הכבד שמופעל על ישראל להימנע מפעילות בשטחי A, לא תהייה ברירה לדרג המדיני אלא להורות על מבצע צבאי נרחב נגד קבוצות הטרור החמושות ביהודה ושומרון שמנסות להתפשט ולהשתלט על שטחים נוספים ביהודה ושומרון ולהפיל את שלטון הרש"פ.