יו"ר מרצ, ניצן הורוביץ, הודיע (מוצ"ש, 23.10.21) שפנה לשר הביטחון גנץ כדי שיציג לממשלה את הממצאים שהובילו להחלטה להכריז על ששת הארגונים הפלשתיניים כארגוני טרור. "כמדינה דמוקרטית, ריבונית וחזקה, ובסיטואציה של כיבוש - ישראל חייבת להיות מאוד, אבל מאוד זהירה בהטלת מגבלות על ארגוני חברה אזרחית פלשתיניים", כתב השר הורוביץ. "יש לכך השלכות בתחום המדיני, יחסי חוץ, והכי חשוב - בתחום זכויות האדם.
עמיתתו למפלגה, השרה תמר זנדברג, גם תקפה את גנץ, ואמרה כי מדובר בהחלטה חמורה, וכי במרצ יבקשו הבהרות: "שלושה מבין הארגונים הם ארגוני זכויות אדם ותיקים וידועים. הרבה פעמים כורכים זכויות אדם, שמאל והתנגדות לכיבוש כטרור - זה לא המצב".
לתוקפים את יו"ר כחול לבן הצטרפה גם חברת הכנסת נעמה לזימי (העבודה), שאמרה: "אלא אם כן קיים מידע מודיעיני שבגינו הוכרזו ארגוני זכויות אדם פלשתינים כארגוני טרור, מדובר במהלך חמור ולא מובן מצד ישראל. יותר מכל מדובר באקט בלתי מוסרי שרומס זכויות לחינם".
מנגד, גיבתה השרה איילת שקד (ימינה) את ההכרזה, ואמרה כי מדובר ב״פעולה חשובה של שר הביטחון, בני גנץ בעקבות מידע מודיעיני מוצק של השב״כ והמט״ל. כבר שנים רבות שהארגונים האלה מתחפשים לארגוני זכויות אדם, כשבפועל הם מהווים תמיכה לפעולות טרור של החזית העממית ודלק לאנשי ה-BDS. מדינות רבות תרמו לארגונים האלה וטוב ששמים לכך סוף״.