מבקר המדינה מתניהו אנגלמן מתייחס לביקורת שמבצע משרד מבקר המדינה בעניין התנהלות המשטרה והפרקליטות בפרשת פגסוס ואומר כי "מבלי להקל ראש בבדיקה הפנימית שמתקיימת במשרד המשפטים, קיימת חשיבות לביקורת של מבקר המדינה שהינו גוף בלתי תלוי". בנאום (יום ה', 17.2.22) בטקס הענקת רישיונות רואי החשבון החדשים בירושלים, אמר אנגלמן: "בימים אלו אנו מבצעים ביקורת בפרקליטות ובמשטרה בנוגע לשימוש באמצעים ובתוכנות הטכנולוגיות, ובין היתר תוכנת פגסוס של NSO. שמירה על פרטיות היא אבן יסוד במדינה דמוקרטית. אין בכוונתנו להתבסס על פרסומים כאלה ואחרים, אלא לבצע בדיקת עומק רוחבית על כל התנהלות גורמי אכיפת החוק באמצעים הטכנולוגיים". את צוות הבדיקה מוביל האגף לביקורת על גורמי האכיפה ולצדו אגף הסייבר שהקים אנגלמן עם כניסתו לתפקיד. "בכוונתנו לשלב בצוות גם יועצים מומחים בתחום הטכנולוגיה כולל יוצאי יחידות המודיעין", אמר. על אופי הבדיקה סיפר: "הבדיקה שלנו תבחן מספר היבטים, ובכללם שימוש גורמי אכיפת החוק באמצעים הטכנולוגיים - האם הייתה חריגה מסמכות והאם החקיקה והאסדרה בישראל ערוכה להתמודדות עם ההתקדמות הטכנולוגית. וכן - מה הנהלים לשימוש באמצעים אלו על טלפונים של אזרחים. כמו-כן אנחנו בודקים את אבטחת המידע של נתונים שנאספו על-ידי המשטרה -האם הם מוגנים מפני זליגת מידע".