ועדת וינוגרד לבדיקת אירועי המערכה בלבנון, הגדירה בדין וחשבון סופי של הוועדה, בפרק השני הנקרא: "עקרונות ואחריות: ממצאים, מסקנות והמלצות", את עקרונות העבודה הרצויים בין הדרג המדיני לדרג המקצועי בקבלת החלטות בנושאים מדיניים ואסטרטגיים. בין השאר קבעה הוועדה את חשיבות תפקודם של "בעלי התפקיד" הביטחוניים וגם אחרים בקבלת החלטות.
הוועדה קבעה כי אמות המידה להערכת תפקודם של בעלי המקצוע הן: מקצועיות, ידע וניסיון, יכולת לראייה אסטרטגית, תחושת אחריות ודבקות במשימה. בעוד הדרג המדיני אחראי לקבלת החלטות, הדרג המקצועי אחראי לאיסוף ועיבוד האינפורמציה בתהליך קבלת ההחלטות, להעלאת אופציות פעולה וכן לביצוע ההחלטות שהתקבלו על-ידי הדרג המדיני. חשיבות שיתוף הפעולה בין שני הדרגים בתהליך קבלת ההחלטה ובביצוע ההחלטה הוא קריטי להצלחת מדיניות.
אז איך מתקבלות החלטות קריטיות וגורליות?
הוועדה גם הדגישה "כי חובת הנאמנות העליונה של אנשי מקצוע היא למקצועם ולתפקידם ולא למי שמופקד עליהם או לארגון בו הם משרתים". במקרים בהם הדרג המקצועי סבור שהממונים עליו "פועלים בצורה שיש בה נזק ממשי, עליהם להתריע על כך, ולא להירתע מעימות עם הממונים. כאשר מדובר בנזק חמור, העלול להיות מסוכן, חובתם של אנשי מקצוע להתריע בפני דרגים עליונים" (עמ' 57).
דומה שפסקה זו בדוח הוועדה רלוונטית מאוד גם ליחסים בין הדרג המדיני לבין הדרג המקצועי בסוגיית אירן, כפי שהיא עולה בשיח המתפתח ביחסים בין שני הדרגים בשאלת התקיפה על מתקני הגרעין באירן. הפער הגדול בתפיסות בין הדרג המדיני הבכיר, ובעיקר זה של נתניהו וברק מצד אחד, ובין הדרג המקצועי (הרמטכ"ל, ראש אמ"ן, ראש המוסד וראש השב"כ), מצד שני, באשר להתמודדות עם סוגיית הגרעין האירני, ובעיקר באשר לתקיפת המתקנים הגרעיניים האירניים, הוא מטריד במיוחד. בעוד הדרג המדיני אינו פוסק מלדבר על הצורך בתקיפת מתקני הגרעין האירניים על-ידי ישראל, הדרג המקצועי מתנגד בתקיפות לכך ואף מתריע בפומבי (דגן) כנגד תקיפה כזו.
החילופים של כל הדרג המקצועי: אשכנזי-גנץ, ידלין-כוכבי, דגן-פרדו, ודיסקין-כהן, לא הביאו כנראה לשינוי מהותי בעמדת הדרג המקצועי. הדרג המקצועי ממשיך להתנגד בתקיפות לתקיפת מתקני הגרעין האירניים על-ידי ישראל ורואה בכך מעשה לא אחראי. אף שאין מחלוקת חוקתית על כך שהאחריות הבלעדית לקבלת החלטה באשר לתקיפת ישראלית מוטלת על הדרג המדיני - וזה יכול לקבל החלטה, גם בניגוד לעמדת הדרג המקצועי - הרי שאין ספק שחשיבות המלצותיו של הדרג המקצועי בהקשר זה היא קריטית במיוחד היכן שיש קונצנזוס מלא בקרב הדרג המקצועי הקודם והנוכחי באשר להתנגדות לתקיפה.
הואיל ותפקידו של הדרג המקצועי הוא להציע לדרג המדיני אופציות פעולה תוך כדי תחשיבי עלויות/תועלות של אופציות אלו, שכן הדרג המדיני אינו יכול לעשות זאת בעצמו - התעלמות מהמלצות הדרג המקצועי המתנגדות לתקיפה, כאשר אלו מבוססות על שיקולים מקצועיים בלבד המבוססים על הערכה מקצועית טהורה, היא חסם יסודי לקבלת החלטות רציונליות ושקולות בתהליך קבלת החלטות במקרה של הסוגייה האירנית.
נוכח הקריטיות של הסוגייה הזו לעתידה הביטחוני של ישראל, חובתו של הדרג המקצועי להשמיע את קולו ולהתריע, במיוחד היכן שהוא סבור שמדובר באפשרות של נזק חמור ומסוכן כפי שוועדת וינוגרד ממליצה בדוח שלה. למרות שאין אנו יודעים מספיק ברזי המתרחש, התנגדותו של הדרג המקצועי לתקיפה ישראלית של מתקני הגרעין האירניים בעוד הדרג המדיני הבכיר רוצה בכך, מעלה תהיות שדאגות רבות באשר לאיכות תהליך קבלת החלטות בהקשר זה.