מפקד משטרת מחוז ירושלים, ניצב אילן פרנקו, העיד (ד', 20.9.06) בפני ועדת זיילר לחקר התנהלות המשטרה בפרשת פריניאן, במסגרת השלב השני שבו מעידים מוזהרי הוועדה.
פרנקו, אשר כיהן בעת מינויו של לוי כימ"ר דרום כראש אגף המודיעין במשטרה, הכחיש בעדותו את החשד לפיו הפעילו הוא והמפכ"ל קראדי לחץ לא תקין למינויו של לוי. "אלה הן רוחות רעות, אי הכרת העובדות, התעלמות מעובדות, ניסיון להזרים דם רע לתאוריית קשר שלא היתה ולא נבראה בשום שלב", אמר פרנקו לחברי הוועדה.
פרנקו דחה בנחרצות את טענותיו של נצ"מ (בדימ.) אמיר גור ולפיהן הכיר היטב את תיק הרצח של העבריין פנחס בוחבוט שנרצח בידי השוטר צחי בן-אור. "בהודעותיו של אמיר גור נאמר באחד החלקים, שאני מעודכן ומדווח אודות הנעשה בתיק הרצח של פנחס בוחבוט, שהוצגו בפני מצגות, שאני מכיר את התיק. לא היה ולא נברא. תיק פנחס בוחבוט לא הוצג לי מימי", אמר פרנקו.
פרנקו, המיוצג בידי עוה"ד איל בסרגליק ומשה ישראל ממשרד עורכי הדין משה ישראל ושות', התייחס בעדותו למה שהוא מכנה "תיאוריית קשר" ולפיה הוא סלל לנצ"מ יורם לוי את תפקיד מפקד ימ"ר דרום, כאשר מינה את בני שגיב שכיהן בתפקיד לכהן כראש מחלק האיסוף באגף המודיעין שהוא, פרנקו, עמד בראשו באותה עת.
"זהו ניסיון להזרים דם רע לתאוריית קשר שלא היתה ולא נבראה בשום שלב, לא בחשיבה על המינויים ולא בביצועם, לא ידעתי שהמועמד להחליף את שגיב הוא יורם לוי, כי הפנייה נעשתה בשלב מאוחר יותר", אומר פרנקו.
בכך מצטרף פרנקו למפכ"ל קראדי שטען אף הוא בפני הוועדה כי מינויו של לוי הינו "מינוי ראוי ומקצועי".
קראדי, אמר בעדותו (א', 17.9.06) כי "כל החלטה שקיבלתי לגבי לוי היתה ממניעים מקצועיים. לפני שמיניתי אותו התייעצתי גם עם מפקד מח"ש, הרצל שבירו, ועם ערן שנדר. הם הסבירו לי שאין תיק פלילי נגד הקצין והחקירה נגדו נסגרה. זה אומר שהוא נמצא ראוי ואין מניעה למנותו".
עם זאת, דבריו של קראדי נסתרו בעדותו של ח"כ יצחק אהרונוביץ' (ישראל ביתנו), שהעיד בפני הוועדה (ג', 19.9.06) על התקופה שבה העביר לקראדי את הפיקוד על המחוז הדרומי של המשטרה.
אהרונוביץ' אמר בעדותו בוועדה: "העברתי תפקיד לקראדי ויידעתי אותו על החשדות נגד לוי על כך שיש לו קשרים עם האחים פריניאן וגם עדכנתי אותו לגבי האחים פריניאן ותיקי הרצח וגם על פרשת בן אור". מעדות זו משתמעת הבעייתיות שהיתה במינויו של יורם לוי כמפקד ימ"ר דרום.