לנהר הירדן איכויות נדירות המייחדות אותו משאר נחלי ישראל: איכויות נופיות וגאולוגיות מיוחדות במינן של נהר הזורם בבקע בין הרים ממזרח ומערב, מערכת אקולוגית עשירה, ציר נדידה ראשי לעופות מאירואסיה לאפריקה וחזרה, אתרי ארכאולוגיה בעלי חשיבות בינלאומית, וכן משמעות היסטורית-דתית-תרבותית לעמי העולם. ראשיתו של נהר הירדן, בצפונה של ישראל, במפגש הנחלים דן, חרמון (בניאס) ושניר (חצבאני). משם הוא זורם ועובר בעמק החולה בואכה לצפונה של הכינרת. מדרום הכינרת ממשיך הירדן וזורם עד לים המלח. האזור שמהכינרת ודרומה עד נחל בזק מוקף בשטחים חקלאיים, בקיבוצים, במושבים ובמוקדי היסטוריה ומורשת המקושרים בחבל טבור לראשית ההתיישבות בארץ וללב ליבה של הזהות וההוויה הציונית והישראלית. בצאתו מהכינרת דרומה מהווה הנהר, בשנים האחרונות, אבן שואבת למגוון קהלי יעד הפוקדים את האזור בכל ימות השנה. האזור הזה מתחלק למקטע מורד הירדן (מהכינרת עד נהריים) ולמקטע הירדן הדרומי (מנהריים עד נחל בזק). במשך שנים רבות היה אזור זה "החצר אחורית" שאליה הוזרמו שפכים, קולחים ומים מליחים. מגמה זו השתנתה לחלוטין עם הכנת תוכנית אב והתגייסות של גופים רבים לשיקום הנהר. בשנים האחרונות מתבצע שיקום של מקטע מורד הירדן ושל מקטע הירדן הדרומי. במורד הירדן מאפשרות פעולות השיקום טיפול בנהר ובגדותיו, בתחומי האקולוגיה, ההידרולוגיה, הוצאת מזהמים, פיתוח שבילים ומוקדי טיילות ועוד. בירדן הדרומי, פעולות השיקום מתמקדות בעיקר בחיזוק החקלאות, הכלכלה המקומית ופיתוח שבילים ומוקדי טיילות. עיקר תקציבי השיקום והפיתוח הגיעו מהקרן לשמירה על השטחים הפתוחים של רשות מקרקעי ישראל. הגופים שעסקו עד כה בפעולות השיקום היו הגופים האזוריים - רשויות הניקוז כינרת וירדן דרומי, המועצות האזוריות עמק הירדן, עמק המעיינות ומחוז הצפון של רשות הטבע והגנים. לגופים אלה חשוב היה להעלות את הטיפול בנהר הירדן לרמה הלאומית. לשם כך הוביל המשרד להגנת הסביבה עם קואליציה של משרדי ממשלה נוספים - משרד ראש הממשלה, משרד החקלאות ופיתוח הכפר, משרד התיירות, המשרד לשיתוף פעולה אזורי, משרד האנרגיה ורשות המים - הצעה להחלטה לשיקום נהר הירדן הדרומי. ואכן, ביום 24 ביולי 2022 התקבלה בממשלה החלטה מספר 1798, ולפיה משרדי הממשלה הרלוונטיים יקדמו את שיקומו ופיתוחו של הירדן הדרומי.