הקשר המיוחד בין הרש"פ לכרים יונס הוא אינדיקציה נוספת ומסוכנת לתמיכתה של הרש"פ בפעולות טרור שמבצעים ערבים שהם אזרחי ישראל. ב-2014 נכלל כרים יונס בקבוצה של אסירים ביטחוניים שעשו פיגועים לפני הסכמי אוסלו והיה אמור להשתחרר עמה מהכלא במסגרת השלב הרביעי של שחרור מחבלים מהכלא הישראלי כחלק מהמשא-ומתן בין ישראל לרש"פ, אך ראש הממשלה בנימין נתניהו עצר את שחרור הקבוצה והמשא-ומתן נפסק.
יו"ר הרש"פ אבו מאזן מינה ב-2017 את כרים יונס לחבר בוועד הפועל של תנועת פתח. הוא מונה כנציג האסירים הביטחוניים לצידו של מרוואן ברגותי. ללמדך, הרש"פ רואה בגורמי טרור מקרב ערביי ישראל שמשתייכים לפתח חלק בלתי נפרד ממנה ומהנהגתה למרות שהם אזרחים ישראלים שאמורים לשמור אמונים למדינת ישראל.
לשכת ראש הממשלה נתניהו גינתה בזמנו את המינוי, אך יו"ר הרש"פ לא ביטל אותו. בשנת 2017 הוביל כרים יונס ביחד עם מרוואן ברגותי את שביתת הרעב של האסירים הביטחוניים אשר נשברה בסופו של דבר, שביתה שהייתה למורת רוחו של יו"ר הרש"פ אבו מאזן אשר ראה בה קריאת תגר של מרוואן ברגותי על מנהיגותו.
בחודש פברואר 2021 ביקר את כרים יונס בכלא "הדרים", חוסיין א-שיח', חבר הנהגת פתח, בשליחותו של אבו מאזן ובאישורה של ישראל, כדי לדון עמו בהכנות לבחירות בשטחים ומניעת התפצלותו של מרוואן ברגותי מתנועת פתח.
ברגותי שקל אז להקים מפלגה נפרדת מפתח ואף להתמודד בבחירות לנשיאות נגד יו"ר הרש"פ אבו מאזן. הנהגת פתח חששה שפיצול הקולות יחזק את תנועת חמאס והיא שתנצח בבחירות.
על-פי הסכמי אוסלו, הרש"פ אמורה להילחם נגד הטרור ולא לעודד אותו. מינויו של אזרח ישראלי שעשה פיגועים ורצח חייל צה"ל לתפקיד בהנהגה הפלשתינית הוא התרסה של הרש"פ מול ישראל והפרה של הסכם אוסלו.
גורמים פלשתינים אומרים כי כרים יונס ימשיך אחרי שחרורו מהכלא לשמש בתפקיד חבר הוועדה המרכזית של פתח. הוא אמור לסייע בפעולות המחאה שמתכנן מטה האסירים הביטחוניים בשטחים ובמגזר הערבי בישראל נגד השינויים שמתכוון להנהיג השר לביטחון לאומי איתמר בן-גביר בכל הקשור לאסירים הביטחוניים בבתי הכלא בישראל.
מטה האסירים הביטחוניים פירסם לפני כמה ימים הודעה שבה אזהרה כי השינויים שמתכנן להחיל השר לביטחון לאומי איתמר בן-גביר יביאו לשביתת רעב של כל 5000 האסירים הביטחוניים ולאינתיפאדה חדשה.
שר הפנים אריה דרעי פנה ליועצת המשפטית לממשלה בבקשה לאשר את תוכניתו לשלול את האזרחות הישראלית מכרים יונס ומבן דודו מאהר יונס. מדובר במהלך נכון, אולם על הממשלה ליזום חוק שיאפשר ביטול האזרחות של מחבלים שהם אזרחי ישראל. מהלך נוסף שמתבקש הוא להטיל הגבלה על תנועותיו של כרים יונס או גירושו לרצועת עזה או לחו"ל כדי שלא יוכל להשתתף בפעילות הסתה והתססה של המגזר הערבי בישראל.
ישראל חייבת להגיב בתקיפות על הפרובוקציה של הרש"פ אשר מגייסת לשורותיה גורמים עויינים מקרב ערביי ישראל, מעניקה להם מעמד בהנהגתה בזכות פעילות הטרור שלהם ומעודדת אותם להמשיך בפעילות הזו גם בתוך שטח ישראל.
