פרל כתב ה"וול סטריט ג'ורנל", חקר את הקשר בין אל-קאעידה לבין טרוריסטים פקיסטנים ובין השאר ערך תחקיר עיתונאי אודות ריצ'רד ריד, שהורשע בניסיון לפוצץ מטוס נוסעים על-ידי חומר נפץ שהוטמן בנעליו. ב-23 בינואר 2002, בדרכו לראיון עם מנהיג טרור במדינה נחטף פרל על-ידי קבוצה שכינתה את עצמה "התנועה לשיקום הריבונות הפקיסטנית". הקבוצה האשימה את פרל כי הוא מרגל, ושלחה לארצות הברית מספר דרישות, לרבות דרישה לשחרור כל הפקיסטנים שנכלאו במהלך המערכה שהובילה ארה"ב נגד הטרור. החוטפים איימו לרצוח את פרל בתוך 24 שעות אם דרישותיהם לא יתקבלו.
חטיפתו של פרל זכתה לסיקור עולמי נרחב ורבים עקבו בחרדה ובדאגה אחר גורלו. החוטפים פרסמו תמונות של דניאל מהשבי, דרשו כופר ודומה היה כי בסופו של דבר ישוחרר.
נרצח באכזריות
אולם כל המאמצים לשחררו משוביו, לא צלחו. דניאל פרל נרצח באכזריות ימים אחדים לאחר חטיפתו. בן 38 היה בהירצחו. הערכה שנרצח ב-1 בפברואר 2002. לאחר חטיפתו, ב-21 בפברואר 2002 פורסם והופץ סרטון מזעזע המתעד את עריפת ראשו של פרל. הסרט נמשך כ-3 דקות. ובו הציג פרל את עצמו: "שמי דניאל פרל, אני יהודי אמריקני מקליפורניה. אני בא ממשפחה ציונית. אבי יהודי, אמי יהודייה, אני יהודי. משפחתי נוהגת לפי דרכי היהדות". כנראה אולץ למסור הצהרה מצולמת זו.
דניאל פרל נולד בפרינסטון שבניו ג'רזי, וגדל בדרום קליפורניה. מ-1981 ועד 1985 למד פרל תקשורת כמקצוע ראשי בסטנפורד והיה ממייסדי עיתון לסטודנטים באוניברסיטה. פרל החזיק באזרחות ישראלית בנוסף לזו האמריקנית והוריו התגוררו בחיפה. את אשתו מריאן פגש ב-1998 וכעבור שנה הם נישאו. בעת שנחטף ונרצח הייתה רעייתו מריאן בהריון (עם ילד ראשון שלא זכה לראות). את שם ילדם אדם, הציע דניאל ימים ספורים לפני הירצחו.
אחרי הרצח הקימו הוריו של פרל עמותה לזכרו ולהנצחתו. על שמו נוסדה קרן דניאל פרל, שנועדה לקדם הבנה בין תרבויות דרך עיתונאות, מוזיקה ותקשורת חדשנית. באפריל 2013 התקיים אירוע הפתיחה של מכון דניאל פרל לעיתונאות בינלאומית (DPIJI) במרכז הבינתחומי הרצליה.
הקשר לבני ברק
יוסי שליט יליד בני ברק מספר לי כי לדניאל פרל יש קשר שורשי לבני ברק. סבא רבא של דניאל היה חיים פרל, ממקימי העיר בני ברק, חבר ועד המועצה וחבר המועצה המקומית בני ברק. על שמו רחוב בעיר. בנו של חיים סבו של דניאל אלעזר פרל היה במשך שנים רבות מזכיר המועצה המקומית בני ברק ובהמשך עירית בני ברק.
אביו של דניאל, פרופ' יהודה פרל גדל בבני ברק. בשנות ה-60 למד הנדסת חשמל בטכניון. ובהמשך עבר להתגורר בארצות הברית שם שימש מרצה באוניברסיטת קליפורניה מתגורר כיום בארצות הברית.