סעיף 539א לחוק שיפוט צבאי קובע:

• הדברים שהושמעו בתחקיר, פרוטוקול התחקיר, כל חומר אחר שהוכן במהלכו וכן הסיכומים, הממצאים והמסקנות (להלן - חומר התחקיר), לא יתקבלו כראיה במשפט, למעט במשפט בשל מסירת ידיעה כוזבת או העלמת פרט חשוב בתחקיר;

• חומר התחקיר יהיה חסוי בפני כל אדם ואולם הוא יימסר, כולו או חלקו, רק לאותם גופים בצבא שהתחקיר דרוש להם לצורך מילוי תפקידם;

• חומר התחקיר לא יימסר לגוף חוקר;

• חומר התחקיר יימסר לפרקליט הצבאי הראשי או לנציגו, לפי בקשתו, בנוגע לאירוע מסוים או בנוגע לסוגי אירועים;

• מצא הפרקליט הצבאי הראשי או סגנו כי חומר התחקיר מגלה חשד לביצוע עבירה, המצדיק בדיקה או חקירה על-ידי גוף חוקר, רשאי הוא, לאחר שנועץ בקצין שדרגתו אלוף לפחות, להורות בכתב לגוף חוקר לפתוח בבדיקה או בחקירה;

כלומר התחקיר המבצעי הוא חסוי, על אחת כמה וכמה תחקיר שעוסק ביסודות ההפעלה של כוחות צה"ל, ברגיעה, בהיערכות ללוחמה ובלוחמה ובייחוד כאשר על הפרק עומד גם מערך המודיעין של צה"ל ועומדת והאינטראקציה בין המודיעין הצה"לי ובין רשויות המודיעין האחרות (הכפופות ברובן למשרד ראש הממשלה). בשל כך תמוהה מאוד אמירתו של דובר צה"ל כי התחקיר המבצעי המתוכנן "יפורסם לציבור כולו" (תא"ל דניאל הגרי ביום ו' בערב בטלוויזיה - במסגרת הודעה יומית "אל מול פני האומה"). ממה נפשך, אם התחקיר יפורסם לציבור כולו אז הוא לא יהיה תחקיר מבצעי, כי: א) על-פי פקודות הצבא תחקיר מבצעי הוא חסוי. ב) הנחקרים יכסת"חו והבכירים שבהם יבואו לעדויות עם עורכי דין בכירים, ואז חבל על הכסף וחבל על הזמן, עדיף בכלל לא להתחיל. ואם התחקיר לא יפורסם לציבור כולו תיפגע אמינותו של דובר צה"ל. מה שסביר הוא שאם יהיה תחקיר מבצעי (ורצוי מאוד שיהיה) חלקו הקטן ביותר יפורסם, אך עיקרו לא יפורסם, לא כעת וגם לא בעוד עשרות שנים קדימה. טוב יעשה דובר צה"ל לעצמו ולנו אם יתקן את דבריו ויתאימם למטרות התחקיר המבצעי ולחוק שיפוט צבאי, טוב יעשה דובר צה"ל אם יתרכז יותר בדברור הצבא, כוחותיו, פעולותיו, הישגיו, אתגריו ופחות בנושאים ציבוריים (למעט מיגון הציבור שנמצא באחריות הצבא).