תקציב ההסתדרות לשנת 2009 אושר (יום ד', 24.12.08) על-ידי הנהגתה, והוא מסתכם ב-406 מיליון שקלים, סכום זהה כמעט לחלוטין לתקציב 2008 שעמד על 409 מיליון שקלים.
הגידול הקל בתקציב נובע מגידול שולי בסעיף השכר של עובדי מנגנון הארגון, אשר עומד על 211.5 מיליון שקלים, לעומת 209 מיליון שקלים בשנת 2008. גידול זה נובע, לדברי ראשי ההסתדרות, מתוספות המתחייבות מהסכמי השכר במשק.
יו"ר ההסתדרות, עופר עיני, אמר בישיבת ההנהגה: "המשבר הכלכלי אינו מאפשר להסתדרות להגדיל את תקציבה". "יחד עם זאת", ציין, "בחרנו שלא להקטין את התקציב כדי לא לפגוע במאות אלפי העובדים שזקוקים לשירותים שמעניקה ההסתדרות, דווקא בעת המשבר הכלכלי הקשה".
ההסתדרות ממשיכה להעניק שירות אך ורק לעובדים הנמנים על שורותיה, והמשלמים לה מסי חבר.
לדברי עיני, שנת 2009 תעמוד בסימן איזון תקציבי מלא, ותהיה זו השנה השנייה ברציפות שבה שומרת ההסתדרות על איזון, לאחר שנים רבות של גירעונות תקציביים.
ראש אגף משק וכספים של ההסתדרות, ישראל אפרת, וגזבר ההסתדרות, מאיר אלפרסי, ציינו יעדים עיקריים נוספים של הארגון לשנת 2009, בהם: התחלת הרפורמה בניהול נכסים, תקציבים וכוח אדם של מרחבי ההסתדרות (יעד אשר הוכרז על-ידי ראשי ההסתדרות החדשה עוד בראשית המהפך בארגון, לפני כעשור), המשך המהלך למחשוב הארגון, המשך ההשקעה בהתמקצעות ועדי העובדים במסגרת המכללה שהוקמה לפני כשנתיים, והמשך ההשקעה בעובדי ההסתדרות בכל הקשור להדרכה והכשרה מקצועית.