המשבר הכלכלי העולמי פגע קשה בחברות להטסת מטענים אל על קרגו וק.א.ל. רשות שדות התעופה (רש"ת) דיווחה כי ק.א.ל, שבבעלות המושבים והקיבוצים, הטיסה בששת החודשים הראשונים של השנה 27,346 טון מטענים - ירידה של 29.7% בהשוואה לתקופה המקבילה אשתקד. הירידה בנפח המטענים של אל על קרגו בששת חודשים הראשונים של השנה הייתה חדה אף יותר והגיעה ל-38% בהשוואה לתקופה המקבילה אשתקד. עוד עולה מהנתונים כי ביוני 2009 הטיסה ק.א.ל 4,340 טון, ירידה של 25.4% בהשוואה לחודש המקביל אשתקד בעוד שבאל על קרגו הגיעה הירידה ביוני ל-40% לעומת נפח שינוע המטענים בחודש המקביל אשתקד.
הנהלת ק.א.ל ביצעה צעדי התייעלות וצמצומים, בהם פיטורי צוותי אוויר ואחד משני המטוסים הישנים של החברה קורקע, ובמקומו נשכר מטוס חדיש יותר. מקורות בדירקטוריון מסרו כי בעלי השכר הגבוה בחברה החליטו לוותר על 10% משכרם. נציגי הקיבוצים בדירקטוריון אמרו כי יתבעו מהבכירים לוותר על שיעור גבוה יותר משכרם.
סמנכ"ל חברת תואם, זרוע היצוא והיבוא של התעשיה הקיבוצית, העריך שמכירת ק.א.ל כמתחייב מהחלטת הבעלים - המושבים והקיבוצים - תידחה, מפני שבמצב שנוצר בענף קשה לראות משקיעים שייכנסו לתחום הטסת מטענים שהוא רגיש מאוד למשברים. עוד אמר סמנכ"ל תואם כי על-אף הקשר של ק.א.ל ותואם למערכת הכלכלית של הקיבוצים, "השיקולים שלנו בבחירת החברות להטסת המטענים הם מסחריים בלבד ואנחנו מנצלים את מלחמת המחירים בין ק.א.ל ואל על לחברות התעופה הזרות".
חבר בדירקטוריון ק.א.ל העריך כי שווי החברה מגיע עד 25 מיליון שקלים. לפני המשבר הכלכלי העריכו מקורות כלכליים בתנועה הקיבוצית את שוויה של החברה למכירה ביותר מ-120 מיליון שקלים. 2007 ו-2008 היו שנים טובות לעסקי החברה והיא סיימה אותן ברווח הנאמד ב-5.5 ו-7.5 מיליון דולר בהתאמה. מנכ"ל החברה הוא יצחק טובלי ויו"ר החברה הוא גם מזכ"ל תנועת המושבים איתן בן דוד.
מק.א.ל נמסר בתגובה כי היא חברה פרטית שאינה מדווחת על החלטות הדירקטוריון. בשל המצב שנוצר בענף התובלה האווירית, מינה בחודש שעבר שר החבורה ישראל כץ ועדה ציבורית לבדיקת ענף ההובלה האווירית. בראש הוועדה יעמוד אל"מ (מיל) מנשה טרם.