עם כניסת הסגר השלישי לתוקף, התחבורה הציבורית ממשיכה לפעול במתכונת רגילה, כפי שפעלה בימים האחרונים. תפוסת הנוסעים באוטובוסים תצומצם ל-50%, אף היקף השירות בתחבורה הציבורית ימשיך במתכונת שהייתה בשבועות האחרונים וקווים בעלי ביקוש גבוה יזכו לתגבור.
עם חתימת התקנות החדשות לשעת חרום, תפוסת הנוסעים באוטובוסים תרד מ-75% כיום, ל-50% ממספר מקומות הישיבה באוטובוס. התחבורה הציבורית בקווים העירוניים והבין-עירוניים תמשיך לפעול במשך כל שעות הפעילות ובכל ימות השבוע, עד לגמר השירות ולא תסתיים מוקדם מהרגיל.
במשרד התחבורה אומרים כי צמצום תפוסת הנוסעים נועד למנוע התקהלויות שלא לצורך ולשמור על בריאות הציבור. במטרה למנוע את עומסים מיותרים גם בתחנות האוטובוס, חברות הסעה פרטיות יתגברו קווים בין-עירוניים בעלי ביקוש גבוה ויאספו נוסעים הממתינים בצירים. לא יתאפשר להן לבצע תגבור בקווים עירוניים.
על-פי הנחיות משרד הבריאות, הכניסה והנסיעה באוטובוסים מותנית בעטיית מסכה וריחוק בין הנוסעים. הנוסעים נדרשים להקפיד על ההנחיות, ואלה ייאכפו על-ידי פקחים מיוחדים. יצוין כי באוטובוסים יופעל מיזוג אוויר ובמידת האפשר האוטובוסים יסעו עם החלונות פתוחים.
רכבת ישראל תמשיך לפעול כפי שפעלה בחודשים האחרונים, בימי ראשון עד חמישי, בין השעות 05:00 בבוקר ועד ל-21:00 בלילה, בתפוסה של 50%, תוך רכישה מראש של שובר הנסיעה.