הרב קניבסקי נטמן בצהריים (יום א', 20.3.22) בבית העלמין זכרון מאיר ש בבני ברק. הוא נטמן לצד רעייתו הרבנית שנפטרה לפני עשור. לקראת הקבורה, פרצו עימותים בין משתתפים בהלוויה לבין שוטרים שאבטחו את הכניסה לבית העלמין. המשתתפים הצליחו לפרוץ את מחסומי המשטרה בכניסה לבית העלמין - ונכנסו אליו. המשטרה פועלת לפנות מסתננים שהגיעו לאור הקבר. על-פי הערכת המשטרה בהלוויה השתתפו כ-850 אלף איש. משרד התחבורה נערך לתגבר את תנועת האוטובוסים והרכבות עם סיום הלוויה. רכבות מיוחדות לירושלים פועלות מתחנות פתח-תקווה קריית אריה, בני ברק ות"א מרכז, משעה 15:00 וככל שיידרש. צוותי מד"א אבטחו רפואית את האירוע והעניקו טיפול רפואי לנפגעים קל בלבד שסבלו מחבלות בגפיים, התייבשות והתעלפות, 15 מתוכם פונו להמשך טיפול בבתי החולים. הלווית הענק של הרב קניבסקי נפתחה בשעה 12:00 מביתו שברחוב רשב"ם בבני ברק. במסע ההלוויה נשאו הספדים הרב גרשון אדלשטיין, הרב יצחק זילברשטיין והרב אליהו מן שהיה תלמידו הקרוב. הרב יצחק זילברשטיין, גיסו של הרב קניבסקי, ספד לו בבכי וסיפר כי בעת שהרב קניבסקי כתב ספר על הלכות כשרות חגבים לא ידע איך בנוי גופו של החגב, ובדיוק אז נחת חגב על חלונו. לדבריו, סיפר על כך לחותן של שניהם, הרב יוסף שלום אלישיב, והוא הזדעזע ואמר שמדובר באירוע שקרה לגדולי ישראל מתקופת הראשונים (בימי הביניים). בכך, ביקש להמחיש למלווים את גדולתו של הרב קניבסקי - תוך השוואתו לדורות קדומים מאוד, הנחשבים בעולם ההלכתי לגדולים בהרבה מן הרבנים הנוכחיים. ראש ישיבת פוניבז', הרב גרשון אדלשטיין, אמר בהספדו כי עם מותו של הרב קניבסקי אבד ה'גברא רבא' - האדם הגדול - היחיד שהיה בארץ ישראל. "כל העולם היו מושפעים ממנו, אין את ההשפעות האלו כאן ובכל העולם. אין גברא רבה (תלמיד חכם) כמוהו בכל העולם, כל הדור יחסר את ההשפעה", אמר הרב אדלשטיין בן ה-98. הרב שלמה קניבסקי, בנו של הרב חיים קניבסקי, ספד לאביו במסע ההלוויה בבני ברק: "תמיד כשהייתי מדבר בפניך הייתי אוהב לומר אדוני מורי ורבי. זו הפעם האחרונה שיש לי את הזכות להגיד את זה. איך אפשר להספיד אותך? אני אדם קטן. הוא היה אחד בדורו". ראש הממשלה, נפתלי בנט, ספד לרב חיים קניבסקי בפתח ישיבת הממשלה ואמר כי היום מובא למנוחות גדול הדור. "לכתו היא אבדה גדולה לעם היהודי. רבות דובר על סגפנותו: הדירה הפשוטה, אורח החיים הצנוע והדל, יצא לי לראות את זה במו עיניי כשביקרתי אותו, הוויתור על החומר לטובת הרוח. האבל הגדול, ההמוני, הוא רגע יהודי מובהק: גבורי התרבות של עולם התורה הם לא ענקי חומר, הם ענקי רוח. הם אנשים שהקדישו את חייהם לתורה ולמצוות, ללימוד מעמיק ולשימור המסורת", אמר. לדבריו, שמו של הרב קניבסקי ייזכר כחלק חשוב בהיסטוריה התורנית של עם ישראל: בנו של הסטייפלער ואחיינו של החזון איש, הוא המשיך את דרכם, את שימור העולם התורני של הקהילות החרבות באירופה שלאחר השואה - בארץ ישראל. יהי זכרו ברוך. "ההלוויה היא אירוע המוני, ועלינו להקפיד שהיא לא תסתיים, חלילה, באסון המוני. לכן, אני קורא לבאי הלוויה לא להצטופף ולא להידחק. הטראומה של אסון מירון עדיין טרייה אצל כולנו, אסור לחזור על הטרגדיה הזו. אני מבקש מכולם אחריות אישית, להשגיח על הילדים בעיקר", אמר. כ-3,000 שוטרים, עשרות אמבולנסים וכוחות של פיקוד העורף נערכו לקראת ההלוויה בבני ברק, שאליה צפויים להגיע כמיליון משתתפים. המשטרה ביקשה מהציבור להגיע למסע ההלוויה בתחבורה ציבורית בלבד, ולהקדים את ההגעה ככל האפשר. רבים הגיעו לחלקת הקבר כבר בשעות הבוקר המוקדמות והשליכו פתקים שכתבו לקבר הטרי. מאות שוטרים מקיפים את חלקת הקבר שנחפר ליד קבר אשתו של הרב, הרבנית בת שבע אסתר קניבסקי. עיריית בני ברק הציבה מסכי ענק ומערכות הגברה באזורים נרחבים בעיר, על-מנת למנוע דוחק באזור ההלוויה. בשעה 6:00 נחסמו כבישים רבים באזור המרכז ועד לשעות הערב תימנע כניסת כלי רכב לעיר בני ברק. במסגרת היערכות המשטרה בירושלים, נחסם החל משעה 06:30 רחוב שמגר לכיוון שפע חיים לתנועת כלי רכב פרטיים ותותר נסיעת תחבורה ציבורית בלבד. בעקבות אזהרות המשטרה, אזרחים רבים נמענו מלהגיע עם הרכב לגוש-דן, והתנועה בכבישים ברחבי הארץ זורמת. מן המשטרה נמסר כי יש להישמע להנחיות השוטרים במקומות אלו וכי משטרת ישראל תפעל לשמירת סדר והכוונת תנועה במקומות אלו ובצירי התנועה לכיוון היציאה מהעיר. השר לביטחון הפנים, עמר בר-לב, אמר בתום הערכת מצב בחמ״ל המשטרה סמוך לבית העלמין בבני ברק: "משנה הזהירות שננקט והמשמעת הציבורית המופגנת הן מפתח לכך שהאירוע יסתיים בשלום".