סיקסמית מציב סימני שאלה כבדים על האישומים הפליליים נגד ליאוניד נבזלין ואחרים, כאילו הורו לרצוח יריבים פוליטיים ועסקיים. הוא מציין שהאישומים נגדם צצו מאי-שם חמש שנים לאחר הרצח ושבמשפט לא הובאה כל ראיה הקושרת אותם אליו. נבזלין עתר נגד הרשעתו במשפט (שנערך בהיעדרו) לבית-הדין האירופי לזכויות אדם. בסוף 2006 חלה תפנית מרתקת. ליטוויננקו, בכיר לשעבר בקג"ב שערק לאנגליה, העיד שהיוזמה למעשי הרצח הייתה של הפס"ב (הגוף שהחליף את הקג"ב) ושצפה בקלטת בה נראה בכיר בפס"ב מוסר למתנקש תמונה של הנרצח ומעביר לו כסף מזומן. זמן קצר לאחר מכן הורעל ליטוויננקו באמצעות תמיסה רדיואקטיבית שטופטפה לכוס התה שלו בלובי של בית מלון בלונדון ומת תוך ימים ספורים.
משפטם של חודורקובסקי ולבדב נפתח ביולי 2004, כשנה לאחר שנעצרו, וארך כשנה. התנהלות המשפט והאישומים שהועלו לא הותירו ספק, אליבא דסיקסמית, שמדובר בתוצאה מוכתבת מראש.
בית המשפט הרשיע את הנאשמים ושלח אותם לתשע שנים בכלא בסיביר, שהופחתו בערעור בשנה. אולם, ב-2010 הוגשו נגד חודורקובסקי ולבדב אישומים תמוהים על מעילה וגניבת נפט ונגזרו עליהם שש שנות מאסר נוספות. בראיון שהעניקה ב-2011 עוזרת שופט ערכאת הערעור במשפט השני, היא סיפרה שנדהמה לגלות שפסק-הדין שהקריא השופט הוכתב לו מילה במילה על-ידי מאן-דהוא בטלפון והיה שונה לחלוטין מזה ששקד עליו במשך ימים.
הרשעתם בדין של ראשי יוקוס זעזעה את הקהילה הבינלאומית וגם בתי-משפט במערב סרבו להכיר בה. דרישת השלטונות הרוסיים מבריטניה להסגיר אליה אחד מבכירי יוקוס נדחתה על-ידי בית המשפט בלונדון, בטענה שמדובר ברדיפה פוליטית. משרד המשפטים הישראלי סירב לבקשת הקרמלין להסגיר לרוסיה את ליאוניד נבזלין בהיעדר ראיות קבילות ובג"צ אישר זאת. ב-2007 דחה בית המשפט העליון בשוויץ את בקשת ממשלת רוסיה להקפיא כספים בחשבונות הבנק של קבוצת מנטפ, בנימוק שהאישומים נגד ראשי יוקוס אינם תקפים מאחר שהוגשו משיקולים פוליטיים.
הנשיא
ג'ורג' בוש קרא לרוסיה "להפסיק להטיל טרור על חברות עסקיות", וקנצלרית גרמניה אנגלה מרקל העלתה במהלך ביקורה במוסקבה ב-2008 בקשה מפורשת לשחרור ראשי יוקוס מהכלא. ארגוני זכויות אדם, בראשם אמנסטי, הכריזו על חודורקובסקי כאסיר מצפון.
קבוצת מנטפ, המנוהלת היום על-ידי עורכי-דין מלונדון הגישה תביעה נגד ממשלת רוסיה, במסגרת אמנת האנרגיה של האיחוד האירופי, לפיצוי של עד 100 מיליארד דולר על הנזק שנגרם מהריסת יוקוס. בית-הדין המיוחד בהאג כבר הכריע לטובת התובעים בשאלות המקדמיות של סמכות והזכות לתבוע, והדיון עצמו יחל בחודש אוקטובר הקרוב. נדמה שסיכויי ההליך טובים, אך תקדימי עבר מלמדים שעלול להיות קשה לאכוף פסק-דין נגד רוסיה בעולם.
ה"נפט של פוטין" מתאר מציאות העולה על כל דמיון, "רומן רוסי" של הון ושלטון. הספר הוא קריאת-חובה מרתקת למי שמתעניין בכלכלה, במשפט, במדיניות-חוץ, בפוליטיקה ובמאבקי-כוח עתירי טסטוסטרון.