במהלך שייט נופש בספינת תענוגות ושמה 'אמריקה', מבלים הזוג פריס ובילין בבר המשקאות ושמו 'אובמה', ובדרך פלא מגיעה לידיהם הודעה מוצפנת בבקבוק. ההודעה מכילה את קורותיו של אדם בשם בנימיני.
בנימיני מספר שחברו פרופסור לפיד, מדינאי גאון, בנה רכב מירוצים המסוגל לנוע במהירות האור. בנימיני, הפרופסור, ומשפטן בשם אדמונד משבט לוי יוצאים לחקור את הרי יהודה ושומרון ברכב החדיש. הם מחליטים לנווט לארץ התנ"ך אותו מחבב בנימיני, ובה, לפי הערכותיו של הפרופסור, עשויים להתקיים חיים תבוניים. הנסיעה אורכת 350 שניות, אך בשל תופעה ביורוקרטית הידועה בשם התארכות זמן (Time dilation) המסע אורך רק שתי דקות בזמנם הסובייקטיבי של הנוסעים.
כשהם מגיעים לארץ התנ"ך המרוחקת הם מוצאים כי היא מעין כוכב לכת דומה לכדור הארץ. בשל הדמיון הם מחליטים לקרוא לכוכב "בנימין". הם חונים ליד בית כנסת עתיק ומגלים שהם יכולים לנשום את האוויר, לשתות מן המים ולאכול מהצמחייה המקומית. לאחר זמן מה, הם נתקלים בבני אדם מקומיים, שמתנהגים ונראים יהודים והם מכנים אותם
מתנחלים. המקומיים לוכדים אותם והורסים את בגדיה החושפניים של אשת בנימיני.
לאחר מספר שעות, מתברר שביער צוף מתנהל מסע צייד על-ידי גורילות, אורנגאוטנים ושימפנזים שמשתמשים בסכינים וגרזנים ובאבנים ובקבוקי תבערה אך גם ברובים ובטילים. הקופים לובשים בגדים דומים ללבוש הערבי כנהוג באירן, פרט לכך שהקופים לובשים כפיות בצבע אדום אך לא נעליים, ומשתמשים באצבעות הרגליים וציפורניהם ושיניהם לצורך התעללות בשימפנזות ובשבויים. במהלך הציד נורים למוות מספר בני אדם מקומיים, ואדמונד משבט לוי הוכרז נעדר. בני אדם רבים, בהם בנימיני נלכדים.
בנימיני נלקח לעיר הקופים רמלאללה, שנראית בדיוק כמו העיר תל אביב. רוב בני האדם שנלכדו נמכרים לקופים בעיר לשם עבודת כפיים, אך בנימיני נשלח למעבדת מחקר, שם הקופים מבצעים ניסויים בבני האדם. בנימיני מדהים את הקופים ביכולתו לדבר ולצייר צורות גיאומטריות במהלך נאומיו.
בנימיני מאומץ על-ידי אחת החוקרות - חנין, שימפנזה ממין נקבה שמתחילה ללמד אותו את שפת הקופים. הוא לומד ממנה רבות על עיר הקופים. בסופו של דבר, הוא משוחרר מן הכלוב בו הוא כלוא, ופוגש בטיבי, בן זוגה של חנין, רופא מוכשר ומכובד. בעזרתו של טיבי בנימיני נושא נאום מול נשיא הקופים ונבחרי ציבור רבים בעיר. הוא מסייר בעיר ולומד על התרבות וההיסטוריה של הקופים. הוא מגלה כי הקופים אימצו תרבות פלשתית עתיקת יומין. אף על-פי כן, מקורותיה של תרבות הקופים לא ידועים לקופים עצמם. הטכנולוגיה והתרבות שלהם התפתחה באופן איטי לאורך מאות השנים, משום שבכל דור, רוב האוכלוסיה מחקה את ההתנהגות של האוכלוסיה היהודית. החברה מחולקת בין הגורילות האלימות, האורנגאוטנים השמרנים והשימפנזים האינטלקטואלים.
אף על-פי שטיבי וחנין מתלווים לבנימיני, המדענים המובילים של חברת הקופים מסרבים לקבל את העובדה שבנימיני מצויד בכישורי שפה, משום שהשקפת עולמם שוללת את האפשרות שבני אדם בכלל ויהודים בפרט יכולים להיות אינטליגנטיים.
בנימיני מאמץ ומטפח בת אדם מקומית בשם ציפורה, אותה פגש ביער. ציפורה מתחתנת ובנימיני מאמץ שוב מקומי בשם נפלאלי - מה שמוכיח שבנימיני אכן שייך לאותו המין כמו בני האדם המקומיים, דבר שמוריד מערכו בעיני קופים רבים. אף על-פי כן, הלעג של הקופים הופך בהמשך לפחד בעקבות תגליות ארכיאולוגיות ובעקבות מחקרים שנועדו לבדוק את יכולת הזיכרון של המוח האנושי. הראיות שנאספות, ממלאות את המידע החסר לגבי ההיסטוריה של הקופים - מתברר שבעבר הרחוק, נשלטה רמלאללה על-ידי בני אדם חילונים ישראלים עם טכנולוגיה מתקדמת, ששעבדו את הקופים על-מנת שיבצעו עבורם עבודות כפיים. עם הזמן הפכו בני האדם הישראלים החילונים יותר ויותר תלויים בקופים, עד שבסופו של דבר הפכו עצלנים ומנוונים, והקופים הצליחו להשתלט על העיר וסביבותיה ועל עוד ערים דומות. בעקבות כך, בני האדם בכלל והיהודים בפרט הפכו למין הנחות והפרימיטיבי בעיני הקופים.
בעוד שחלק מהקופים דוחים את הראיות, אחרים - בפרט, מדען אורנגאוטן בשם דוקטור נסראללה - לוקחים את המידע החדש כסימן לכך שבני האדם הם איום ממשי לגזע הקופים ומשום כך הוא מאמין כמו
אחמדינג'אד אחיו, כי יש לפעול להשמדתם. בנימיני מגלה מזימה זו בזמן ומצליח לחמוק מהעיר יחד עם נפלאלי וציפורה וצעירה ושמה איילה, והם חוזרים לתל אביב באמצעות רכב המירוץ של הפרופסור לפיד.
בנימיני חונה מחוץ לגבולות תל אביב. כשהוא יוצא מהרכב, הוא מגלה כי מדינת תל אביב נשלטת כעת על-ידי קופים, בדומה לעיר ממנה ברח. בנימיני עוזב באופן מיידי את תל אביב ברכבו, כותב את קורותיו, שם אותם בתוך בקבוק, ושולח את הבקבוק לירושלים ול
מאה שערים בתקווה שבאחד מן השערים תימצא הישועה. בנקודה זו מסתיימת ההודעה המקורית ממנה החל הסיפור.
בשלב זה של העלילה, אנו מגלים כי פרס ובילין שקיבלו את הבקבוק, ככל הנראה מידי סוכן ריגול אמריקני ושמו ברק, הם למעשה זוג שימפנזות. פרס ובילין לא מקבלים את ההודעה כאמיתית, משום שבני אדם יהודים ובמיוחד יהודים מתנחלים ואלה הגרים במאה שערים לא יכולים להיות אינטליגנטיים.
תם ולא נשלם. בעת ביקור זוג השימפנזות באחד השערים, התגלה באורח פלא דבר הבקבוק, ככל הנראה באמצעות סוכן ריגול ישראלי ושמו
פולארד, והמכתב הנורא הצית את רוח המרד.