הוועדה המחוזית לתכנון ולבנייה הכירה הבוקר (ג', 24.11.09) בטענת עמותת "אדם טבע ודין" כי אזור צומת הנגב עדיין איננו בטוח לשהיית חיילים, בשל הזיהום המגיע מרמת חובב, ולכן מצאה לנכון להתנות בתוכנית תנאים להבטחת הטיפול בזיהום הסביבתי.
הוועדה מתנה בתוך מסמכי התוכנית הוראה מחייבת, לפיה לא תאוכלס עיר הבה"דים אלא אם שנה לפני מועד האיכלוס תהיה איכות האוויר ברמה המבטיחה את בריאות הציבור במרחק של 6 ק"מ מרמת חובב.
תנאי נוסף שקבעה הוועדה לאיכלוס עיר הבה"דים, הוא הצגת "נוהל חירום והרתעה בעת אירוע חומרים מסוכנים", ובכך הכירה הוועדה בטענת "אדם טבע ודין", לפיה החומרים המסוכנים הכרוכים בפעילות רמת חובב, יוצרים סיכון לאירוע חומרים מסוכנים בצומת הנגב.
בד בבד החליטה הוועדה על הקמת ועדת מעקב שבה יושבים נציגי משרדי ממשלה, מועצת רמת חובב, מועצה אזורית רמת נגב ומתכנן המחוז, שתפקידה לפקח על מצב איכות האוויר ולקבל נתונים באופן שוטף על המטרדים הסביבתיים בשטח התוכנית. הנתונים על אודות הניטור בשטחי התוכנית יובאו בפני מוסד התכנון, שישקול אותם בעת הוצאת היתרי בנייה.
בתגובה לדברים אמרה עו"ד ציפי איסר-איציק, מנכ"ל "אדם טבע ודין" כי "ההחלטה אומנם מנסה לתת מענה לסיכונים אלה בתוך מסמכי התוכנית, וזה בהחלט צעד ראוי. יחד עם זאת, יש לבחון האם הוועדה הינה בעלת סמכויות אופרטיביות להבטיח את המטרות שלשמן הוקמה, ובהתאם למסקנות נשקול את המשך צעדינו".