אחוז ההצבעה בבחירות לכנסת ה-21 נותר גם בשעות האחרונות להצבעה נמוך מזה שנרשם במערכות הבחירות הקודמות. עד לשעה 20:00 בערב, שעת סגירת הקלפיות ביישובים הקטנים ושעתיים לפני סגירת שאר הקלפיות ברחבי הארץ, הצביעו 3,884,636 אזרחים המהווים 61.3% מכלל המצביעים. זאת, לעומת 62.4% שהצביעו עד לשעה 20:00 בבחירות 2015 ולעומת 63.7% בבחירות 2013.
ועדת הבחירות המרכזית הודיעה כי פתקים שהושחתו במטרה לפוסלם בעת הספירה ייחשבו לקולות כשרים. זאת, בעקבות תופעה נרחבת של השחתת פתקים העלולה לפגום בביטוי האותנטי של רצון המצביעים בבחירות לכנסת ה-21.
על-פי הודעת ועדת הבחירות, פתק שחורר או שקשקשו עליו באופן שברור שנעשה לצורך פסילתו, ייחשב קול כשר. עוד נמסר כי פתק שדוגמתו שונה מזו שאישרה ועדת הבחירות המרכזית, כמו פתק ששונה בו סדר המילים בכינוי הרשימה או שהאות של הרשימה נמצאת מתחת לשמה של הרשימה, יאושר גם הוא. בכל מקרה שבו יימצא פתק שהושחת או חורר, הוא יישמר אצל ראש ועדת הקלפי, ואם יימצא עוד פתק עם אותו פגם - שניהם יאושרו, כמו גם כל פתק נוסף עם אותו פגם.
הנחת היסוד של ועדת הבחירות המרכזית היא שהימצאות פתק מסומן אחד בלבד בסימון מובחן עלולה להוביל לחשיפת ההצבעה של המצביע שהטיל את אותו פתק לקלפי ובכך לפגום בחשאיות הבחירות.