שלמה פילבר לא חשף ברשות ניירות ערך את פגישת ההנחיה עם בנימין נתניהו, למרות שנשאל על כך במפורש. פילבר אומר ששכח עובדה זו; התובעת, עו"ד יהודית תירוש, טוענת שהוא הסתיר אותה במתכוון עד שהחליט להפוך לעד מדינה. הדברים עלו (יום ג', 5.4.22) בסיום חקירתו הראשית של פילבר בתיק 4000.
תירוש טענה, כי פילבר לא הופתע לגלות בחקירתו את הקשר בין נתניהו לבין שאול אלוביץ, ולכן אין צידוק לדבריו ולפיהם התבטא בחריפות ובסערת רגשות. הוא השיב: "אמרתי ביום הראשון שאם הייתי יודע בזמן אמת את מה שנאמר לי - הייתי שם את המפתחות בו ביום. מטיחים בי את כל מה שמטיחים בי, ויש טיוטת כתב אישום, ואני מושעה לשבעה חודשים, ואז מגיעים בשש בבוקר אנשים חדשים ועוצרים אותי ואני מדבר עם עורכי הדין שלי - אני מבין שאני בעולם אחר לגמרי.
"לא חלמתי שהמדינה תפתח בחקירה נגד ראש הממשלה ותעצור אותי לשמונה ימים בלי שיש ראיית זהב נגדי, אם אין לה מארג ראיות מושלם. זה הלך הרוח שלי. אני משער שלמדינת ישראל יש מסמכים המלמדים שבמשך שלוש שנים אלוביץ ונתניהו מנהלים מאחורי גבי עסקה שאני לא מודע לה, ואני במשך שנתיים אני מתאמץ עד אין קץ לעשות את מה שתיארתי כאן. ואז אני מבין שאת הפגסוס שמה לי מדינת ישראל בצורה בלתי חוקית בגלל שהייתה ארוחת ערב בין נתניהו לאלוביץ, ושהמעצר שלי מבוסס על איזשהו SMS של אילן ישועה.
"בהאזנת הסתר שמעתם דברים אחרים ממה שנאמר פה, ואמרתי שאני לא קשור. שמו לי פגסוס, כי חשבו שימצאו דברים אחרים במיילים וכדומה - וגם שם מצאו דברים הפוכים ממה שציפו למצוא". עו"ד ז'ק חן ציין, כי ההגנה אינה יודעת מה נמצא בפגסוס; תירוש השיבה: "גם פילבר לא יודע".
פילבר הוסיף: "הייתי בטוח שכל מה שאני צריך לעשות בחקירה הוא להסביר מה עשיתי במשרד ולכן לא ביקשתי עורך דין ביום המעצר. נתקלתי בחומה בצורה, במין זלזול. אתה נתקל בקיר אטום ומרגיש שאתה לא יכול להסביר את עצמך. הם רק רצו לדעת עם מי זה היטיב. בסוף אמרתי שזה היטיב עם פרטנר וסלקום, כי לדעתי כל הטלפוניה הייתה גלולת רעל של פרטנר כדי לעכב את התשתיות.
"אתה בא בנפש חפצה כדי להסביר מה אתה רוצה לעשות לטובת המדינה, ואתה נתקל בחוקרים שרואים הכל בשחור-לבן". תירוש: "נתנו לך להגיד כל מה שרצית". פילבר: "בנקודות מסוימות הייתי עם הגב לקיר ולא רצו לשמוע ממני תשובה מורכבת. זוהי תחושתי הסובייקטיבית". תירוש: "אני לא מתווכחת עם תחושות".