חשד לפיגוע ירי נוסף שביצע פלשתיני סמוך מאוד למקום שבו נרצחו האחים הלל ויגל יניב ז"ל לפני כשלושה שבועות, בכפר חווארה שבמרכז השומרון. מחבל פלשתיני שעמד בצד הכביש העובר במרכז חווארה, ואשר משמש את התושבים הישראלים המתגוררים ביישובי גב ההר בשומרון, פתח בירי לעבר רכב ישראלי שנסע בכביש.
כתוצאה מן הירי נפגעו שני בני אדם שנסעו ברכב - אדם אחד כבן 30 נפצע קשה בפלג גופו העליון ואישה נפגעה קל. נהרג הרכב המשיך בנסיעה לעבר כיכר סמוכה, שם היו צוותים של מד"א ושל צה"ל.
ממד"א נמסר כי הדיווח על הירי התקבל במוקד 101 במרחב ירקון בשעה 15:57. "חובשים ופרמדיקים בסיוע כוח רפואה של צה"ל העניקו במקום טיפול רפואי לשני פצועים, בהם אחד קשה", לשון הדיווח הראשוני. הפצועים פונו על-ידי מד"א לבתי חולים. "חברנו עם הרכב בכיכר עינאבוס יחד עם כוח רפואה של הצבא. הענקנו טיפול רפואי לגבר בשנות ה-30 שנפצע באורח קשה מירי בפלג גופו העליון ולאישה שלקתה בחרדה. העברנו אותם במהירות לאמבולנסים ופינינו אותם לבית החולים כשמצבו של הגבר קשה", סיפר חובש בכיר במד"א, משה מאיר שמעון.
גורמים צבאיים דיווחו כי המחבל השתמש בנשק מאולתר מסוג קרלו, וכי כלי הנשק ששימש אותו בפיגוע אותר בזירת הירי. כוחות צה"ל החלו לבצע סריקות נרחבות באזור כביש 60 לכיוון העיר שכם ולכיוון ההתנחלות יצהר. בעקבות הפיגוע ולנוכח הסריקות נחסם לתנועה כביש 60 מצומת תפוח ועד לצומת יצהר ובין צומת יצהר לצומת ג'ית (ציר גלעד).