כוחות צה"ל, שב"כ ומג"ב בפיקוד עוצבת הקומנדו וחטיבת מנשה, המשיכו לפעול גם הלילה לסיכול טרור במחנה הפליטים ג'נין. דובר צה"ל, תא"ל דניאל הגרי, אמר הבוקר (יום ג', 4.7.23) כי עד עתה עצרו הכוחות 120 חשודים לחקירה וכי נותרו להם כעשרה יעדים מסומנים במרכז מחנה הפליטים. לוחמי הימ"מ איתרו והשמידו לפנות בוקר פיר תת-קרקעי ששימש לאחסון מטענים. השמדת הפיר בוצעה בלב מחנה הפליטים ג'נין, על-פי מידע מודיעיני שהועבר למשטרה משירות הביטחון הכללי. לוחמי מגלן איתרו והשמידו שני חמ"לים לניהול לחימה שהקימו ארגוני הטרור. לוחמי סיירת נח"ל איתרו והשמידו מטול נפץ ומטען ולוחמי יחידת ניצן (636) איתרו והחרימו אמצעי לחימה וציוד צבאי. מדובר צה"ל נמסר כי הכוחות ממשיכים לפעול לסיכול טרור בעיר ובמחנה הפליטים ג'נין.