על הסכנות הביטחוניות אמר: "עלינו להיות ערוכים לבאות, הרוחות ממזרח מבשרות על אתגר שעומד לפתחנו צה"ל נשען על תחקיר בלתי מתפשר אתגרי הפיקוד התעצמו לאחרונה, עלינו להיערך ולהתכונן ללא הפסקה לאיום הבא המצוי מעבר לפינה להקדים את האויב ולעולם לא לזלזל בו". אלוף פוקס סייג את דבריו, וטען כי אינו מכליל את כל המתיישבים: "עשיתי כל שביכולתי להגן על תושבי האזור. התייחסתי בכובד ראש לכל אבן. כל אחד ואחת שנפל - צרב אותי, לא תמיד הצלחתי, לעיתים נכשלתי. אשא איתי את מחיר הדמים לעד. מ-7 באוקטובר האתגרים הפכו מורכבים יותר. אני עומד על דבריי - רובם המוחלט של תושבי האזור הם אזרחים שומרי חוק ערכיים שראויים לכל הערכה, ועושים זאת לצד איומי טרור שמרחפים מעליהם כל העת. ראינו זאת בהתנדבות, במסירות, בלחימה הארוכה ובמחירים כבדים עד מאוד בכל מקום ומקום.

הוא התייחס בנאומו גם לרמטכ"ל, שהקפיד לגבות את פעולותיו לאורך השנה האחרונה, ואמר בהתייחסו לביקורת שמשמיעים כלפיו שרים בממשלה: "אני בוש ונכלם מהתקפות הפרועות שאתה חווה. דברים נוראים נאמרים ואז מגיעה התנצלות רפה". לאחר מכן עלה הרמטכ"ל, רב אלוף הרצי הלוי, והודה לפוקס: "תודה לך יהודה, גם בשם המיעוט שמגנה ולא יודע להעריך". עוד הוסיף: "העברת דגל פיקוד המרכז מיהודה לאבי הוא אירוע קצר אך משמעותי מאוד. זוהי הזדמנות עבורנו להביט לאחור, לבחון את הדרך שעברנו, לשאוב ממנה תובנות, להתברך בהישגים, להכיר בכשלונות וללמוד מהם – תוך בחינת האתגרים – אלה שהיו ואלה שעוד יבואו. פיקוד המרכז, שמפקדתו מצויה בירושלים בירתנו, נושא באחריות על חבלי מולדת משמעותיים בהיסטוריה של עם ישראל. "האחריות הזו כרוכה באתגרים גדולים – דריכות מתמדת במציאות נפיצה, התנהלות אל מול מציאות דחוסה ואינטנסיבית, של מאמץ עיקש ובלתי מתפשר לסיכול טרור – מאמץ שכל רגע בו, מתורגם לחיי אדם. צה"ל פועל בסביבה אזרחית שבתוכה גורמי טרור מחד-גיסא, ומאידך-גיסא תושבים, יישובים וצירים שהיו והינם מושא ההגנה המרכזי של הפיקוד, ובו־בזמן מרחב תפר המחייב ערנות ופעילות רציפה".

דבריו של אלוף פוקס זכו לגינויים חריפים בימין. אסתי ושלום יניב, הוריהם של הלל ויגל שנרצחו בפיגוע בחווארה: "מצער אותנו מאוד שהאלוף פוקס שבפיקודו נרצחו ילדינו בפיגוע טרור רצחני, בוחר להשתלח במעשים שוליים שאינם מייצגים אפילו לא מיעוט מתושבי יו"ש. במקום לקחת אחריות על תקופה מהקשות שהיו ביו"ש בפיקודו ולדבר על הטרור שמרים ראש פעם אחר פעם בחר פוקס להתעלם מנושא זה. אין לנו אלא להצטער על דבריו של פוקס ולקוות לימים טובים יותר" ח״כ צבי סוכות (הציונות הדתית): ״אלוף הקונספציה הולך הביתה. מי שתולה את הביטחון בחוזקה של הרשות הפלשתינית וחושב שהחשש מ-82% תומכי חמאס הוא 'זריעת פחד' מיותרת היה אחראי על ביטחון היהודים ביו"ש עד היום. ‏שלום ולא להתראות״. ח״כ שמחה רוטמן (הציונות הדתית): "אפשר לדבר על 'להישיר מבט אל מול האמת'. ‏אפשר לדבר על כך ש'הפשיעה הלאומנית הרימה ראש'. ‏אי אפשר להגיד את שני המשפטים האלה ביחד". ח״כ לימור סון הר מלך (עוצמה יהודית): "זהו נאום התהליכים של יאיר גולן על סטרואידים - ניתוק מוחלט מהמציאות בשטח והפניית אצבע מאשימה לכיוון הלא נכון. הנאום מתעלם לחלוטין מהסכנה האמיתית - הטרור הפלשתיני המתגבר. הקונספציה השגויה הזו שולטת ביהודה ושומרון ומסכנת את ביטחוננו. אנחנו בסכנה אמיתית כל עוד מפקדי צה"ל ממשיכים להתעלם מהאיום האמיתי ולהתמקד ב'סכנת ההקצנה' בקרב המתיישבים. מטרידה אמירתו של פוקס ש'יכולת הפיקוד לעמוד במשימות תלויה גם בקיום רשות פלשתינית חזקה'. זוהי אמירה מנותקת ומסוכנת. הרשות הפלשתינית מעודדת ומממנת טרור, וההבדל בינה לבין חמאס הוא רק ביכולת. אם הרשות הפלשתינית תוכל לעשות לנו אותו דבר כמו חמאס - היא תעשה זאת ללא היסוס". ח"כ גלעד קריב (העבודה): "גיבור בשדה הקרב וגיבור בערכיו ובעמדותיו. האלוף פוקס - תודה על עשרות שנות שירות ועל תרומתך האדירה לביטחון המדינה. רוב מכריע של אזרחי ישראל שותפים להכרת התודה לך. תודה שבחרת לכלול בנאום הפרידה גם את האמירות הברורות הבאות - הפשיעה הלאומנית של מיעוט מהמתנחלים נגד הפלשתינים סותרת את ערכיה של היהדות ואת ערכיה של מדינת ישראל. היא נתקלת בשתיקה ובהתעלמות. רשות פלשתינית חזקה ומתפקדת היא חלק ממרכיבי הביטחון של מדינת ישראל. כך גם שגרת חיים סבירה ומכובדת למיליוני פלשתינים בשטחים. את נאום הפרידה של האלוף פוקס צריך ללמוד בבית הספר לקצינים. זו הייתה צריכה להיות עמדתה של ממשלת ישראל. אבל בניגוד לאלוף יהודה פוקס בראשות ממשלת ישראל עומד מנהיג חלש, פחדן וחסר יושרה". תנועת רגבים: "אנחנו משתדלים לכבד אנשי צבא וביטחון, אך האלוף בדימוס פוקס שוגה באופן חמור מאוד בהבנת המציאות ודבריו המנותקים על הרש"פ מעידים כאלף עדים שאלוף פיקוד מרכז עדיין שרוי בקונספציה איומה. בדבריו נחשף למעשה, כי תפיסת הביטחון שלו נשענת על הרשות הפלשתינית; אותו גוף המממן, התומך והמייצר טרור מדי יום באופן גלוי כפי שעלה במחקר 'שוטרים ביום, מחבלים בלילה' שפרסמנו לאחרונה. עם הפרידה מהאלוף, ראוי שניפרד גם מתפיסות מעוותות אלו". ארגון תורת לחימה: "סופו מעיד על תחילתו. קצין קונספציה משובש לחלוטין. פוקס כשל במשמרת של שלוש שנים, והוביל פעילות אקטיבית של סימון המתיישבים כאויב, פשוטו כמשמעו, תוך שימוש בחיילי צה"ל כ'ביום אויב' של יהודים. פוקס האטום אכול שנאת ישראל ושנאת ארץ ישראל. עשרות נרצחו בגלל שהעדיף זכויות אויב בדגש על תנועה בצירים, על פני חיי יהודים. קיני הטרור בג'נין, שכם, טולכרם, קלקיליה, חברון ועוד גואים בעשרות אלפי כלי נשק, מטעני חבלה ומחבלים שמקיימים צעדות לאור יום, ומעשי רצח בלילה. יור ממיליון יהודים בערי קו התפר וישובי יו"ש, אנשים, נשים וטף נמצאים בסיכון ישיר לטבח ממחבלי הרשות הפלשתינית, החמאס והג'יהאד האיסלאמי. אלוף פוקס הותיר ליורשו האלוף בלוט אדמה חרוכה ועבודת שיקום ארוכה. אנו קוראים לאלוף בלוט לתקן ולשנות את המדיניות ב-180 מעלות, לא להיות 'פוקס 2' כדי חלילה לא להיות 'הרצי, חליווה ופינקלמן 2' כאחראי לטבח הבא. חובת האלוף הנכנס 'להיות בן אדם - ולנצח'". פורום הצופות - דורשות ביטחון בבית: "אם בטקס לאלוף הנכנס בלוט בחר שר הביטחון להדגיש את הצורך בשימוש בכוח מועט, ואם בטקס פרידה בחר האלוף היוצא להצטרף לשקרים האנטישמיים על אלימות המתנחלים, הרי שמדובר בדור הנהגה כושל שעליו להתחלף מיד. לאלוף היוצא פוקס שבחים רבים כלוחם וכמפקד וכן כמי שסייע להתיישבות ולחוות ביו"ש, אך דבריו בטקס הם חרפה ובלבול עצום בהבנת האויב. שיתוף הפעולה עם הטענות ההזויות שלא עולות בשום נתונים רשמיים, הפניית הגב לתושבי יו"ש שנלחמים על חיי אזרחי ישראל בחזיתות השונות והדיבורים המנותקים על הרשות הפלשתינית שעדיין בוחרת בטרור, מצביעים לא רק על כיוון פוליטי לקוי אלא על ערכים מוסריים לקויים במיוחד ועל בוחן מציאות קלוקל". ראש מועצת שומרון יוסי דגן: "לאלוף פוקס יש זכויות בהגנה על המולדת ולא ניקח ממנו זאת. יש לי מחלוקות רבות איתי בנושא קונספציות ביטחוניות שהובילו לפיגועים קשים לפני ה-7.10 ולצערי ויכוחים רבים גם אחרי, אך גם אחרי הדברים הללו חובה לכבדו. ובאותה מידה הדברים חייבים להיאמר - דברי האלוף פוקס בטקס הפרידה הם פסולים ערכית וחמור מכך - גם לא נכונים עובדתית. לפי נתוני מחוז ש"י ישנה ירידה חדה במקרי האלימות של הקומץ הקטן הזה שהתקשורת, והאלוף פוקס עסוקים בהם שוב ושוב. "האלוף פוקס יודע זאת היטב כי גם לפי נתוני פיקוד מרכז הרשמיים שהודלפו לפני זמן לא רב, ישנה ירידה דרמטית במקרים אלו לאחר תחילת המלחמה. באופן אישי אני דרשתי מפיקוד המרכז לראות את הנתונים הללו. הם סירבו לתת אותם ועולה החשש כי הם יודעים למה. "אם לא תהיה לי ברירה - אביא את הדרישה לקבלת הנתונים המוסתרים שלהם לבית המשפט. ניצול המעמד הצבאי ומדי צה״ל לסגירת חשבונות ע"י קצין בצה"ל זה כשל ערכי. מי שרוצה להיות יאיר גולן 2 שיעשה זאת בזירה הפוליטית. מישהו שמע פעם מפקד מחוז במשטרה משתלח בראשי העיר ובמערכת החינוך בתל אביב בגלל דקירות בברים או בגלל מעשי הפשיעה במחוז?! הדברים מהווים יקיקה בפרצופם של הנופלים. מספר הנופלים במלחמה מישובי יהודה ושומרון הוא פי ארבעה(!) משיעור התושבים באוכלוסייה. כמעט אין אצלנו יישוב שאין בו נופלים, נגמרו לנו הדמעות מרוב בתי האבלים. בכל פעם שאתם מזכירים את אהבת המולדת וההקרבה של בני ההתיישבות ביו״ש תזכרו שהם צמחו בחינוך שלנו, בקהילות שלנו, אותה מערכת חינוך והנהגה רבנית וקהילתית שאלוף פוקס השמיץ היום בצורה כה פוליטית. הנאום הפוליטי הזה ירקה בפרצוף שלהם".