בצל היחסים המתוחים בין ראש הממשלה לשר הביטחון, פורסם בחדשות 13 כי זמן קצר לפני התקיפה האחרונה באירן שלח גלנט מכתב חריף לראש הממשלה ולשרי הקבינט בו הביע דאגה עמוקה מהתנהלות המלחמה מול אירן ומהתנהלות המהלכים בזירות השונות. "המלחמה מתנהלת ללא מצפן מתוקף" כתב יואב גלנט, והדגיש את הצורך בעידכון מטרות הקבינט בעקבות ההתפתחויות האחרונות. גלנט פתח את מכתבו בקריאה לרענן את היעדים לניהול המלחמה, ובמיוחד בזירות המפתח - עזה, לבנון, אירן ויהודה ושומרון. לדבריו, המהלומות הישירות בין ישראל לאירן מדגישות את הצורך להתאים את מטרות הלחימה להתפתחויות בשטח: "חילופי המהלומות הישירים בין ישראל לבין אירן מגדילים את הצורך לקיים דיון ולעדכן את מטרות המלחמה בהסתכלות כוללת על הזירות והזיקה ביניהן" כתב גלנט במכתבו. במכתב הוסיף גלנט כי השארת היעדים הקיימים ללא רענון מעמידה את המערכה בסיכון לניהול לא אפקטיבי ומגבילה את ההחלטות האסטרטגיות של הקבינט: "מצב הדברים בו אנו מתנהלים ללא מצפן מתוקף וללא עידכון מטרות פוגע בניהול המערכה ובהחלטות הקבינט". בנוסף לקריאה לעידכון מטרות המלחמה, גיבש גלנט במכתבו סדרת יעדים שלדעתו יש לפעול לקידומם. בזירה העזתית כתב גלנט כי על ישראל לפעול ל"ביסוס מציאות נטולת איום צבאי, מניעת התעצמות של יכולות הטרור, השבת כל החטופים וקידום חלופה לשלטון חמאס". בלבנון הוא מדגיש את הצורך "ליצור מציאות ביטחונית שתאפשר את חזרת תושבי הצפון בהקדם לבתיהם". במערכה מול אירן הציב גלנט כיעד את שמירת ההרתעה כלפי אירן ומניעת מעורבותה הישירה בלחימה. בהתייחס לזירה ביהודה ושומרון ציין גלנט כי יש למנוע "התפרצות אלימה באמצעות סיכול טרור", ולפעול לחיזוק הביטחון האישי של תושבי האזור תוך חיזוק הלגיטימציה הבינלאומית למהלכי ישראל. בלשכת ראש הממשלה הביעו תמיהה לנוכח מכתבו של גלנט והגיבו בהודעה רשמית: "מדובר במכתב תמוה - יש מצפן אחד והוא יעדי המלחמה כפי שנקבעו על-ידי הקבינט. הם נבחנים כל הזמן ואף הורחבו לאחרונה". הגורמים בלשכה טענו כי המטרות הקיימות נותרו רלוונטיות ומתאימות להתפתחויות האחרונות, ואין צורך בעריכת שינויים מהותיים. ברקע המכתב עומדים יחסים מתוחים בין ראש הממשלה לשר הביטחון, שהועצמו על-רקע חילוקי דעות על אופן ניהול המלחמה. גורמים בקבינט רואים במכתב ביטוי של חילוקי דעות אסטרטגיים, וייתכן כי הוא מעיד על הקרע הקיים בנוגע לעידכון היעדים. בנוסף, מכתב זה לא נשלח לשר לביטחון לאומי איתמר בן-גביר, מה שגורמים במערכת הביטחון פירשו כמהלך שנועד למנוע הדלפות.