צה"ל שינה ב-7 באוקטובר 2023 את הוראות הפתיחה באש, כך שניתן היה לפגוע במספר רב של אזרחים ברצועת עזה במסגרת חיסול מחבלים. כך חושף (26.12.24) ניו-יורק טיימס בתחקיר נרחב, המבוסס לדבריו על עשרות מסמכים ו-100 ראיונות, כולל עם 25 מבין המעורבים בהליכי האישור לתקיפות השונות.
על-פי התחקיר, בשעה 13:00 ביום פרוץ המלחמה - בעוד אנשי חמאס טובחים, אונסים וחוטפים ישראלים ביישובי העוטף - הוציא המטכ"ל פקודה שהעניקה לקצינים בדרגי ביניים הרשאה נרחבת לתקוף אלפי מטרות בעזה, לרבות פעילים בדרג זוטר של חמאס. על-פי הפקודות, קצינים הורשו לאשר תקיפות שעלולות לסכן את חייהם של עד 20 אזרחים - מספר גבוה משמעותית מהמגבלות שהיו נהוגות בעבר (בין הימנעות כליל מפגיעה באזרחים לבין עשרה במקרים נדירים).
קצין בכיר הסביר לעיתון, כי המטכ"ל האמין באותן שעות שישראל ניצבת בפני איום קיומי. לדבריו, הייתה חובה להפעיל כוח רב כדי למגר את הסכנה, לבצע אלפי תקיפות מן האוויר בזמן קצר, ולכן היה צורך לבזר את סמכויות האישור שנמצאות בדרך כלל בידי הפיקוד הבכיר בלבד. באותן שעות קריטיות גם היה חשש כבד מפלישה אפשרית של חיזבאללה בלבנון וצה"ל נאלץ לרתק לגזרה ההיא כוחות רבים.
לטענת הטיימס, כדי לפרק את חמאס בעזה מיכולותיו, ישראל "החלישה משמעותית" את מערכת הפיקוח שהייתה אמורה למנוע פגיעה באזרחים, אימצה שיטות שגויות לאיתור מטרות והערכת הסיכון שנשקף לחפים מפשע, התעלמה מאזהרות של קצינים בצה"ל ושל בכירים בארה"ב בנוגע לכשלים, ולא עשתה רבות גם בתחקירים שלאחר התקיפות שפגעו באזרחים, או בהענשת אלו שפעלו שלא כשורה.
לפי התחקיר, ב-8 באוקטובר בשעה 22:50 הוציא המטכ"ל פקודה נוספת, ולפיה ניתן לסכן את חייהם של 500 אזרחים מדי יום; מגבלה זו הוסרה לאחר יומיים. משרד הבריאות ברצועה, הכפוף לחמאס, טוען ש-45,000 אזרחים נהרגו במלחמה - אם כי ברור שנתוניו כוללים גם אלפים רבים ואולי רבבות אנשי חמאס, ושאזרחים רבים נהרגו משום שחמאס בחר במכוון למקם אנשיו, מפקדותיו וכלי הנשק שלו בלב איזורים מאוכלסים בצפיפות.
בכמה מקרים, כאשר התקיפות כוונו למנהיגי חמאס, בכירים בצה"ל אישרו אותן תוך ידיעה שכל אחת מהן מסכנת יותר מ-100 אזרחים, באופן שלדברי העיתון "חצה בצורה יוצאת דופן רף שנקבע על-ידי צבאות מערביים מודרניים". צה"ל, כך נטען, תקף בקצב כה מהיר, עד שמאגר המטרות המאומתות מלפני המלחמה התרוקן תוך ימים ספורים. כתוצאה מכך, צה"ל אימץ מערכת חדשה ו"לא-מוכחת" למציאת מטרות חדשות, שלפי הטיימס התבססה על שימוש בבינה מלאכותית בהיקף נרחב.