"צוותי ביקורת ממשרדי נתקלו בהתנהלות ובפרקטיקות - המיושמות על-ידי נציגי המינהלת שהקים צה"ל בלשכת סגן הרמטכ"ל כדי לרכז ולשלוט על כל הקשר מול משרד מבקר המדינה - המנוגדות למקובל מזה עשרות שנים בביקורות המדינה הנערכות בצה"ל ובגופים מבוקרים אחרים, וזאת באופן הפוגע בצורה חמורה בהליכי הביקורת". כך טוען (6.1.25) מבקר המדינה, מתניהו אנגלמן, במכתב לרמטכ"ל, רב-אלוף הרצי הלוי, בנוגע לביקורת בנושא מלחמת חרבות ברזל. לדברי אנגלמן, נציגי המנהלה בלשכתו של אלוף אמיר ברעם נוכחים בכל הפגישות עם אנשי צה"ל ואף מקליטים אותן. קצין אחד אמר לצוות הביקורת שהוא הוחתם על מסמך המגביל את יכולתו למסור מידע, ואחר סיפר שתודרך לפני הפגישה עם הצוות. לטענתו, אסור להקליט את הפגישות ולהשתמש בהן ללא אישורו, ואופן התנהלות זה "משגר 'מסר של הרתעה והפחדה' במשתמע כלפי דרגי שטח וקצינים הכפופים לפיקוד העליון, ועלול להוביל לחשש משיתוף פעולה מלא עם ביקורת המדינה ולסיכול חשיפת האמת בפני מבקר המדינה וכפועל יוצא לפגיעה חמורה ביותר בהליכי ביקורת המדינה". עוד טוען אנגלמן, כי אנשיו מתקשים לקבל מצה"ל מסמכים, למשל בנוגע למסיבת הנובה וההסברה הבינלאומית. "אני רואה בחומרה פעולות אלו אשר יש בהן כדי לפגוע בהליך הביקורת התקין שבמסגרתו על בעלי התפקידים למסור מידע מלא כמתחייב מהחוק וללא חשש מהשלכות פעולתם, ועל הגוף המבוקר להעביר מסמכים הנדרשים לביקורת המדינה מיד וללא עיכובים", כותב אנגלמן. "בכוונתי לעמוד על כך שהליכי הביקורת בצה"ל יתנהלו בהתאם למתכונת הביקורת שנהוגה מזה עשרות שנים, תוך שיתוף פעולה מלא עם הביקורת (כפי שאף צוין מפורשות בהחלטת בית המשפט העליון מ-21.11.24), כל זאת על-מנת למנוע פגיעה ביכולתי לבצע ביקורות מקצועיות ומבוססות", מוסיף אנגלמן. הוא דורש להימנע מכל נוכחות של נציגי לשכותיהם של הלוי וברעם בפגישות של אנשי משרדו עם אנשי צה"ל; שתיעוד המפגשים ייעשה ויישמר בידי אנשי משרדו; שצה"ל לא ישתמש בהקלטות שכבר ביצע; ואנשי הביקורת יקבלו מיד את המסמכים שיבקשו. אם כל אלו לא ייעשו בתוך תשעה ימים, מזהיר אנגלמן, הוא ייאלץ להזמין את נציגי צה"ל למשרדו להצגת מסמכים ומתן עדות - כולל תוך שימוש באמצעי כפייה בדמות צווים וקנסות.