שר הביטחון ישראל כ"ץ תוקף (8.1.24) את תגובת הצבא להנחייתו, ומבהיר כי הפעם לא יעבור בשתיקה על התנהלותו הפוליטית של תא"ל דניאל הגרי. בהודעה שהוציאה לשכתו, נמסר: "דובר צה"ל, שהתנצל לא מכבר על שחרג מסמכותו, ותקף את הדרג המדיני - שוב חורג מסמכותו, תוקף ומטיף מוסר לדרג המדיני. התנצלות הפעם לא תספיק". כ"ץ הנחה את את הרמטכ"ל רא"ל הרצי הלוי לאפשר לצוותי הביקורת של מבקר המדינה גישה לכל חומר שיידרש, ולשתף פעולה באופן מלא עם הליך הביקורת. בתגובה, מסר דובר צה"ל בין היתר כי "המפקדים שמנהלים את הקרבות הם גם אלה שמבצעים את התחקירים. קשב פיקודי חסר בלחימה, עלול לעלות בחיי אדם". למרות טענות מבקר המדינה, טען הגרי שצה"ל משתף עימו פעולה באופן מלא ומתח ביקורת על כך שהביקורת נערכת במהלך מלחמה. עוד הוסיף הדובר: "צה"ל מחויב לאיכות התחקירים לפני מהירות עשייתם ויעשה הכל לסיימם באופן מקצועי מהר ככל שניתן". הוא סיכם את תגובתו בעקיצה לשר כ"ץ וכתב: "פתרון הסוגיות צריך להתקיים בשיח בין שר הביטחון לרמטכ"ל ולא דרך התקשורת". מנכ"ל משרד מבקר המדינה, ישי וקנין, הגיב על דברי דובר צה"ל בראיון לגלי צה"ל: "צה"ל לא משתף פעולה איתנו בהתנהלות שלו. זה לא יכול להיות". עוד חשף וקנין: "גילינו שבחלק מהדברים מתדרכים את הקצינים - "אתה מדבר רק על דבר א' ואסור לך לדבר על דבר ב'". הוא תקף את הרמטכ"ל הלוי: "בכל פעם שאנחנו מבקשים חומר אומרים לנו שצריך לאשר אותו בדרג מעל ורק אחרי חודש מביאים לנו מסמכים - ואלה מסמכים חסרים". מבקר המדינה מתניהו אנגלמן ביקש הבוקר להיפגש עם שר הביטחון כ"ץ. ייתכן שזו הסיבה שכ"ץ פרסם את הודעתו התקיפה נגד צה"ל בעניין שיתוף הפעולה עם מבקר המדינה. בשלב זה, עדיין לא ברור האם נקבעה פגישה בין השניים, אך מאז כניסתו של כ"ץ לתפקיד שר הביטחון - הוא טרם נפגש עם אנגלמן. במערכת הפוליטית מיהרו לגבות את שר הביטחון. חברת הכנסת קטי שטרית (הליכוד) אמרה: "אני שומעת מבוקר עד לילה שאנחנו לא רוצים בוועדת חקירה ממלכתית. יש כאן שר ביטחון שמתווה מדיניות, שרוצה בחומרים הרלוונטיים לטובת בדיקה, ודרג צבאי שמתבלבל פעם אחר פעם. עמוד התווך של אותה חקירה יגולם בתוצאות הבדיקה הצבאיות. מה מונע מהרמטכ"ל להעביר אינפורמציה". סגן השר אבי מעוז (נעם) אמר: "אדוני שר הביטחון - הגיע הזמן לפטר את הרמטכ"ל ויחד איתו את דובר צה"ל. היום כולם יבינו את המהלך. הם פשוט הגדישו את הסאה". בארגון תורת לחימה מייחסים את הודעת הדובר לרמטכ"ל עצמו, ואומרים כי "בהודעת רמטכ"ל הסרבנות והמחדל נגד שר הביטחון: נפלה המסכה ונגמרה ה'שכונה' של הדיפסטייט בצה"ל נגד קרבנות מחדליו, ונגד הציבור ונבחריו". עוד הוסיפו: "בפורום מטכ"ל כמו במערכת המשפט, בטוחים שהם מדינה בתוך מדינה, וצבא שיש לו מדינה. זה ככל הנראה מה שהביא לטבח הנורא. הסרבנות והמחדל הנורא הם תוצאה ישירה של החוצפה האיומה של קציני הקונספציה שבזים לציבור ונבחריו, ומחויבים למועדון הסגור של חבורה פוליטית במדים. חובת שר הביטחון להדיח מיד את הרצי, הגרי וכל שכבת קציני הפרוגרס והקונספציה, ולנקות אורוות בצה"ל. הם לא ראויים לעם של גיבורים, לא ראויים ללוחמים המופלאים שמחפים על מחדליהם בגופם ובדמם. רק אחרי פיטורי הקצונה הבכירה הפרוגרסיבית בראשות הרצי הלוי - נוכל לתקן ובעזרת ה' לנצח".