המכון לרפואה משפטית באבו כביר קבע לפנות בוקר (יום שבת), כי שירי ביבס, שהובאה לישראל לאחר חצות, נרצחה באכזריות על-ידי חוטפיה. גופתה של שירי ביבס, שנחטפה מביתה בקיבוץ ניר עוז, הובאה לישראל הלילה לאחר חצות. בבדיקה נקבע כי שירי נרצחה במהלך שבייתה בעזה, וכי מותה לא נגרם מחמת הפצצה של צה"ל, כביכול, כפי שטען חמאס. הודעה נמסרה הבוקר למשפחה.
בצהרי יום שישי הודיע דובר צה"ל, כי ילדיה של שירי, כפיר ואריאל, נרצחו בדם קר בידיים חשופות של חוטפיהם, וכי לאחר מכן הושחתו הגופות כדי לשוות לזאת מוות כתוצאה מהפצצה של צה"ל.
קדמה להשבת גופתה של שירי דרמה גדולה. ביום חמישי הובאו לישראל, במסגרת ההסכם, ארבע ארונות ובהם ארבע גופות: שני ילדיה של שירי, כפיר ואריאל; עודד ליפשיץ; וגופה נוספת של שירי, כביכול. בבדיקת המכון הרפואי התברר כי הגופה הנוספת הינה של עזתית אנונימית. הדבר עורר זעם רב הן בישראל והן מצד גורמים רבים בחו"ל המעורבים בסגירת המו"מ עם חמאס. ראש הממשלה
בנימין נתניהו איים על חמאס ודרש להביא מיד את שירי; נשיא ארה"ב
דונלד טראמפ ובכירי ממשלו קבעו כי מדובר בהפרה חמורה של ההסכם. ארגון חמאס טען כי כנראה מדובר בטעות, וזו תוקנה הלילה.