משרד החינוך נמנע במכוון מהפעלת פיקוח אקטיבי על בתי הספר החרדיים, וכתוצאה מכך הם מקבלים את מלוא המימון הממשלתי למרות שאין בהם לימודי ליבה כנדרש. כך טוענת עמותת חדו"ש בעתירה לבג"ץ, בה היא מבקשת (6.3.25) להפחית כבר השנה את המימון בהתאם להיקף לימודי הליבה. העתירה מכוונת נגד משרדי החינוך והאוצר, עוסקת בשתי רשתות החינוך החרדיות העיקריות: מעיין החינוך התורני של ש"ס והחינוך העצמאי של אגודת ישראל ודגל התורה. לטענת חדו"ש, הימנעותו של משרד החינוך מהפעלת פיקוח אפקטיבי שיציג תמונה אמיתית של היקף לימודי הליבה ברשתות, מובילה לכך שהם מקבלים תקצוב מלא למרות שהמשרד יודע שרובם - ובמיוחד המוסדות לבנים - אינם מלמדים את מלוא לימודי הליבה ושלאור זאת יש להפחית את המימון עבורם. בעתירה נטען, כי "נוהלי הפיקוח מונעים פיקוח מלא ומעמיק על לימודי הליבה: המפקחים, שמספרם נמוך מדי, מקבלים הנחיות מטעות לחישוב היקף סך לימודי הליבה הנדרשים; לא נערך חישוב נפרד להיקף הלימוד הנדרש בכל אחד ממקצועות הליבה; הם אינם קושרים בין היקף לימודי הליבה הנטענים להיות בתוכנית הלימודים בכל מוסד לבין כשירות כוח ההוראה ללמד את מקצועות הליבה השונים במוסד; הם מונחים להתעלם מסירוב הרשתות להשתתף באופן מלא בבחינות חיצוניות כחלק מבחינת העמידה בדרישות לימודי הליבה". חדו"ש אומרת כי הדברים נלמדים מהודאת משרד החינוך עצמו בעתירה קודמת של העמותה, ומכך ששר החינוך, יואב קיש, ביקש במפורש אשתקד לדחות בארבע שנים את ההחלה המלאה של דרישות הליבה. "בחלק ניכר ממוסדות הרשתות לא נלמדים לימודי ליבה מלאים, חסר בהם כוח הוראה שהינו בעל כשירות ללמד לימודי ליבה, ומניפולציות שונות, דוגמת תוכנית לימודים לפי 'אשכולות' של מקצועות ליבה, חלף המקצועות עצמם, מרוקנות מתוכן את דרישת ההוראה של לימודי ליבה בהיקף מלא", היא טוענת. עוד נטען, כי למרות (ואולי בגלל) שהמצב ידוע לו, בחר משרד החינוך "להפעיל מערך פיקוח חלקי, מגמתי וכושל ולא פעל להשבת כספים ששולמו ביתר למוסדות הפועלים בניגוד לחובותיהם בדין ואשר מנהליהם הצהירו הצהרות כוזבות על עמידה בדרישת לימודי הליבה". לטענת חדו"ש, המשרד גם התעלם מהצטרפות המונית של מוסדות חינוך חרדיים לשתי הרשתות, שנעשתה על בסיס הונאה במטרה לקבל את המימון המלא בלא לימודי ליבה מלאים. העתירה הוגשה באמצעות עוה"ד יפעת סולל ואורי רגב.