העימות בין משרד מבקר המדינה לבין הסנגוריה הצבאית מגיע לשיא חדש, לאחר שהסנגוריה הגישה עידכון לבג"ץ בו טענה כי המבקר חורג מסמכותו בבדיקת אירועי 7 באוקטובר. לטענת הסנגוריה, נושאים אלו שמורים לוועדת חקירה ממלכתית בלבד, והמשך הביקורת עלול לפגוע בזכויות חיילי צה"ל ולשבש את עבודת ועדה עתידית. בתגובה חריפה, משרד מבקר המדינה מסר כי "ההודעה "הבהולה" לבג"ץ ממחזרת טענות ישנות שמטרתן אחת - לשבש את הליכי הביקורת. המבקר, מתניהו אנגלמן, הדגיש כי הביקורת מתבצעת על כלל הדרגים - המדיני, הצבאי והאזרחי - וכי היא כוללת גם את כשלי הליבה שהובילו למחדל החמור ביותר בתולדות המדינה". המבקר ציין כי "הביקורת בצה"ל מתבצעת בהתאם למתווה מוסכם עם צה"ל והשב"כ, שקיבל תוקף של פסק דין באפריל 2025. הביקורת המדינית והאזרחית מתנהלת מזה למעלה משנה, ובמסגרתה פורסמו דוחות הכוללים ביקורת אישית על בכירים בממשלה ובמערכת הביטחון". היועץ המשפטי למבקר המדינה, עו"ד יואל הדר, השיב לסנגוריה כי אין לה מעמד משפטי לתקוף את המתווה, וכי העלאת הטענות בעיתוי הנוכחי נועדה ככל הנראה לשבש ולעכב את הביקורת. לדבריו, "הציבור הישראלי זכאי לתשובות, והניסיון להשתיק את מוסד ביקורת המדינה חמור במיוחד". במשרד המבקר הבהירו כי הם לא יירתעו מהלחצים, וכי תפקידם הוא לספק לציבור את התשובות שהוא ממתין להן מזה כשנתיים. "אין זה ראוי שלובשי מדים יתדרכו ויתקפו שומרי סף כפי שמעזה לעשות כעת הסנגוריה הצבאית", נמסר.