מנהיג גם מתוך הכלא
בשנת 2021 רשם רשימה עצמאית לבחירות לפרלמנט, שבוטלו. כמה שנים קודם לכן הנהיג שביתת רעב של מעל 1,500 אסירים שנמשכה 40 יום, בדרישה לשיפור תנאי הכליאה. מועמדותו נתפסה אז כקריאת תיגר על יו"ר הרשות הפלשתינית אבו מאזן.
לדברי מומחה המזרח התיכון מוין רבאני, ברגותי הצליח לגשר בין פלגים פלשתינים ואף פנה לדיאלוג עם ישראלים. הוא "נתפס כמנהיג לאומי אמין, כזה שיכול להוביל את הפלשתינים – בניגוד לאבו מאזן שנכשל בכך שוב ושוב".
ישראל, לדבריו, שמרה על מדיניות של חלוקת הפלשתינים והחלשת הרשות, ולכן נמנעה משחרורו. גם עבאס עצמו ראה בברגותי איום פוליטי.
פרופ' אייל זיסר מאוניברסיטת תל אביב ציין כי ברגותי לא היה מעורב בשחיתות שפגעה במעמד הרשות, ויכול היה לחזק את מוסדותיה – תרחיש מאיים עבור ממשלת הימין בישראל, שהתנגדה לכל צעד לקראת מדינה פלשתינית.
ברגותי נראה לאחרונה באוגוסט, כאשר השר לביטחון לאומי
איתמר בן-גביר פרסם סרטון בו נזף בו בתא הכלא, ואמר שישראל תתמודד עם כל מי שפועל נגדה ו"תמחק אותו".