ארגון הג'יהאד האיסלאמי פרסם הודעה רשמית שבה אישר כי שני המחבלים שחוסלו ביום חמישי בג'נין על-ידי לוחמי משמר הגבול היו חברי גדודי אל-קודס, הזרוע הצבאית של הארגון. לפי ההודעה, יוסף אסאסא, בן 37, שימש כמפקד שטח, ואילו מחמוד עבדאללה, בן 26, הוגדר כלוחם. האירוע התרחש במהלך פעילות סיכול ממוקד של כוחות הביטחון בג'נין, שבמהלכה נפתחה אש לעבר הלוחמים. לפי גורמים פלשתינים, שני המבוקשים נתפסו חיים ונכנעו - אך נורו למוות לאחר מכן. מנגד, גורמים ישראלים טוענים כי הלוחמים פעלו תחת איום ממשי ובמסגרת הפקודות. הג'יהאד האיסלאמי הדגיש כי השניים "נפלו כשהגנו על אדמתם", והבטיח להמשיך בפעולות נגד ישראל. בתיעוד שהפיצו הפלשתינים נראים שני מבוקשים יוצאים מהמבנה שעליו סגרו כוחות מג"ב, מניפים ידיים ויורדים על הברכיים - ואז נורים למוות. לפי הודעת צה"ל והמשטרה:

• "במהלך פעילות של כוחות מג"ב וצה"ל בעיר ג'נין, פעלו הכוחות למעצר מבוקשים שביצעו פעולות טרור ובהן השלכת מטענים וביצוע ירי לעבר כוחות הביטחון. הכוחות נכנסו למרחב, סגרו על המבנה בו שהו החשודים והפעילו נוהל הסגרה שנערך מספר שעות. עם הפעלת כלי הנדסי על המבנה, יצאו שני המבוקשים. לאחר שיצאו מהמבנה, בוצע ירי לעבר המבוקשים. האירוע מצוי בתחקור מפקדים בשטח, ויועבר לבחינת הגורמים המוסמכים."

בעקבות התקרית החריגה, והתלונות שהוגשו מצד ארגוני שמאל בישראל, פתחה המחלקה לחקירות שוטרים בבדיקת נסיבות הירי. שלושה לוחמים מיחידת המסתערבים של מג"ב איו"ש נחקרו ביום שישי. במח"ש חוקרים האם הירי שבוצע עומד בדרישות החוק והפקודות המבצעיות. עם סיום קבלת עדותם, שוחררו הלוחמים עם תנאים מגבילים.