נשיא המדינה, יצחק הרצוג, אומר (6.12.25) שהוא מכבד את קריאתו של דונלד טראמפ להעניק חנינה לבנימין נתניהו, אך ישראל היא מדינה ריבונית ויש לכבד את דרישותיה של המערכת המשפטית. הוא דיבר בראיון לאתר Politico. הרצוג אמר על בקשת החנינה שהגיש נתניהו: "אין ספק שזו בקשה יוצאת דופן, וכאשר אעסוק בה - אביא בחשבון מעל הכל את האינטרסים של העם בישראל. טובתו של העם בישראל נמצאת במקום הראשון, השני והשלישי בסדר העדיפות שלי". בתשובה לשאלה על החנינה שהעניק אביו, חיים הרצוג, בפרשת קו 300, אמר הרצוג: "כל אחד מבין שכל חנינה מוקדמת צריכה להישקל בהתאם לנסיבותיה. יש נושאים רבים לדון בהם. מצד אחד, השוויון המלא בפני החוק, ומצד שני - כמובן הנסיבות הייחודיות של כל מקרה". בהתייחסו ללחציו של טראמפ, אמר הרצוג: "אני מכבד את ידידותו ודעתו של הנשיא טראמפ. מדוע? כי כפי שאני אומר לישראלים, זהו אותו נשיא שהתחנן וביקש להחזיר את החטופים שלנו, ושהוביל באומץ מהלך עצום להשבת החטופים ולהחלטה באו"ם [בנוגע לעתיד עזה]. אבל באופן טבעי, ישראל היא מדינה ריבונית ואנחנו מכבדים בצורה מלאה את המערכת המשפטית הישראלית ודרישותיה". הרצוג נשאל האם הוא חושש להשלכות מצד טראמפ אם בקשת החנינה תידחה. הוא השיב: "אני לא חושב שאני צריך לדבר על כך בפרהסיה. יחסינו עם טראמפ וממשלו הם חמים, ישירים וגלויים. יש לראות זאת בהקשר הנכון, ולא לקפוץ לכל מיני ניתוחים הרי אסון". בכך הגיב הרצוג שלא במישרין על דבריה של השרה עידית סילמן, לפיהם טראמפ עלול להטיל עיצומים על אישים במערכת המשפט אם לא תינתן חנינה.

אחת האפשרויות: חנינה תמורת ועדת חקירה

אמש פורסם, כי אחת האפשרויות שבוחן הרצוג היא חנינה בתמורה להקמת ועדת חקירה ממלכתית למלחמה. בחדשות 12 דווח, כי הוא אמר למקורביו: "התיק הזה חונק אותנו, בלעדיו יכל להיות הרכב ממשלה אחרת - שיוציא אותנו מהצרה הצרורה שבה אנו נמצאים. זאת הזדמנות שאסור לי לפספס. מיום העצמאות אני אומר שצריך להגיע לפתרון כי אני רואה את ההשפעה הרעילה של המשפט הזה על כולנו". עוד אומרים בסביבתו של הרצוג, כי במקביל יש לבדוק האם אפשר לקרב את הצדדים להסדר טיעון, כאשר התחושה היא שעד היום לא מוצתה אפשרות זו בין היתר, נבחנת האפשרות להציע ששני הצדדים ייפגשו בבית הנשיא תחת חסותו של הרצוג ויגיעו לעסקת טיעון או הסדר. היועצת המשפטית, גלי מיארה, דחתה את קריאת בית המשפט להליך של גישור פלילי ועמדה על כך שההגנה תפנה אליה לצורך ניהול מו"מ על הסדר. ההערכה היא, שהסיכויים להסדר פחתו משמעותית לאחר עדותו של נתניהו בחקירה הראשית. נשיא בית המשפט העליון בדימוס, אהרן ברק, שניסה להוביל להסדר שכזה בדצמבר 2021, אמר לאחרונה, כי הזמן הולך ואוזל.