במהלך הדיון עלו גם טענות בדבר המשמעות הכלכלית והחינוכית של שינוי הנוסח. ח"כ
סימון דוידסון התריע כי הסרת ההגבלה על ההפרדה לכיתות בלבד עלולה להוביל להפרדה רחבה בכלל תחומי הלימוד והפקולטות, לרבות מקצועות עתירי משאבים. לדבריו, "האקדמיה היא כור היתוך, ואם נהפוך אותה למסלולים סגורים, נפגע ביכולת ההשתלבות בחברה הכללית".
גם נציגי האקדמיה הביעו הסתייגות. הפרופסור אורנה קופרמן מהאוניברסיטה העברית סיפרה מניסיונה בשילוב חרדים בלימודים: "במסלולים הנפרדים לתואר ראשון, רבים מהחששות התממשו. נדרש שיכפול של מערך ההוראה, והסטודנטים קיבלו לעיתים מוצר אקדמי נחות. בתארים מתקדמים זה עלול להיות חמור עוד יותר".
מן העבר השני נשמעה גם תמיכה נשית חרדית בהצעה. אושרה דנוך אמרה כי "החוק הוא בשורה של ממש. הניסיונות לוותר על הערכים שלנו בשם שילוב - לא יעבדו".