"התועלת שבהפרדת מח"ש מפרקליטות המדינה היא מוגבלת, בעוד שפוטנציאל הנזק לעצמאותה של היחידה, ליכולתו של העומד בראשה לעמוד מול לחצים של דרג פוליטי, למקצועיותה של היחידה ולפעולתה לפי סטנדרטים מקצועיים אחידים עם יתר גופי אכיפת החוק והחשש מפני פגיעה בשלטון החוק באופן כללי - הוא משמעותי ביותר". כך מתריע (24.2.26) פרקליט המדינה, עמית איסמן, בנוגע להצעת החוק להפרדת מח"ש מהפרקליטות והכפפתה למנכ"ל משרד המשפטים. במקביל אומרת היועצת המשפטית לממשלה, גלי מיארה, כי "ההצעה תביא להשתלטות פוליטית על מח"ש ולהפיכתה מגורם שמטרתו להגן על האזרחים לכלי בידי השלטון לניווט חקירות נגד שוטרים ולהכוונת התנהגות המשטרה לפי צרכי השלטון. ההצעה סותרת לחלוטין כל דוח ציבורי שעסק במבנה מערכת אכיפת החוק או מח"ש". על-פי ההצעה, לשר המשפטים תהיה למעשה שליטה במינוי ראש המחלקה. את ההצעה יזם ח"כ משה סעדה (לשעבר סגן ראש מח"ש שלמעשה הודח ממנה, ומי שספג ביקורת נוקבת מבית המשפט המחוזי בירושלים על התנהלותו בפרשת רונאל פישר) והיא נדונה בוועדה משותפת לוועדות החוקה והביטחון הלאומי. לדברי איסמן, "עצמאותה ומקצועיותה של מח"ש הן ערובות חשובות לעצמאות ולמקצועיות המשטרה. פגיעה ביכולתה של מח"ש למלא את תפקידה כגוף אוכף חוק עצמאי ומקצועי, תוביל בסופו של יום להגברת החשש מפני ההתערבות הפוליטית בפעולתה של המשטרה". איסמן דוחה את הנימוק המרכזי של סעדה (המסתמך על עמדת הרוב בצוות שבדק את עבודת מח"ש) ולפיו קיים ניגוד עניינים בשל קשרי גומלין בין הפרקליטות לבין המשטרה בתיקי פשיעה חמורה. הוא אומר כי מח"ש טיפלה בחומרה בשורה ארוכה של קצינים בכירים, ובכל מקרה - מדובר באחוז קטן מאוד מכלל התיקים שבטיפולה. עוד טוען איסמן, כי ההפרדה תגרום נזק כבד, משום שכאשר מח"ש לא תהיה כפופה להנחיות היועץ המשפטי לממשלה ופרקליט המדינה - אמות המידה לאכיפת החוק על שוטרים יהיו שונות מאשר לכל אזרח אחר. קבלת ההחלטות תהיה במח"ש בלבד, בלא ההירככיה והבדיקה הקיימות בפרקליטות המדינה, ולא תהיה כל דרך להבטיח שהן עולות בקנה אחד עם מדיניות האכיפה הכללית. איסמן מוסיף ומזהיר: "הצעת החוק מעלה חשש ממשי להתנגשות בלתי נמנעת בין היחידה המוצעת לבין משטרת ישראל, בליווי פרקליטות המדינה והיועצתה משפטית לממשלה, בפרט במקרים של חקירות רגישות. עלול להיווצר תמריץ להגשת תלונות על-ידי הנחקרים, בפרט בתיקים רגישים בפרופיל ציבורי גבוה, ליחידה המוצעת, נגד מבצעי החקירה במשטרה