על אף הצלחות המב"מ, הנסיבות הנוכחיות מחייבות להכיר גם במגבלותיו. בעוד שניתן לזהות רידוד בכוח הצבאי האירני בדרום סוריה, הן כתוצאה מהמב"מ והן כתוצאה מדעיכתה של מלחמת האזרחים, אין להסיק מכך, כי נחלשו גם כוחו של חיזבאללה והתפקיד הבולט שהארגון ממלא במרחב. הדגש המרכזי במודל ההתבססות האירני, נכון להיום, הוא שימור כוחו ומעמדו של חיזבאללה – בדרומה ובעומקה של סוריה.
בדרום, בסמוך לגבול עם ישראל, אירן מתבססת בעיקר על חיזבאללה; על יחידות הצבא הסורי הנתונות להשפעתה (ביניהן דיביזיה 4 בפיקודו של מאהר אסד, אחיו של הנשיא); וכן על בניית מיליציות הגנה מקומיות, שאותן היא מציידת ומאמנת. שני גופים מרכזיים של חיזבאללה הם מפקדת הדרום, המשלבת קציני חיזבאללה כיועצים ומפקחים בשורות הצבא הסורי, ויחידת "תיק הגולן" בפיקודה הישיר, המקימה תאי טרור שמבוססים על סורים מקומיים. חיזבאללה נאלץ אומנם לשלם את מחיר ההתבססות שגובה המב"מ ולצמצם לעיתים פעילותו נוכח לחץ המוטל עליו מצד המשטר, אולם כוחו נותר משמעותי וניכר כי אין בכוונת אירן לוותר על התפקיד שהוא ממלא בסוריה.
בכל הנוגע ל"תקיעת הטריז" בין אירן לסוריה. הצלחת המב"מ חלקית בלבד ונראה שהיא מובילה לשינויים מדודים וטקטיים יותר מאשר לשינוי אסטרטגי במערכת היחסים בין טהרן לדמשק. כך, בשאר אסד, המבקש לבסס את ריבונות שלטונו בשטח סוריה, מטיל מפעם לפעם הגבלות על האירנים וביניהן צמצום חופש התנועה שלהם במעברי גבול, סייגים להברחת סחורות לסוריה, שפוגעות בכלכלה הסורית, וכן איסור על תקיפת ישראל משטחי סוריה. אף דווח, כי אסד אסר בעבר על אירן להעביר אמצעי לחימה דרך שדה התעופה בדמשק.
ברם, תקיפת שדה התעופה בדמשק בתחילת יוני העידה, כי האירנים אינם מקפידים למלא את הוראותיו של הנשיא הסורי. מכל מקום, ספק האם אסד מעוניין באמת להגביל את הפעילות האירנית, שכן הוא חב לטהרן את שרידותו. אם בעתיד המב"מ אכן יוביל את אסד לסלק משטח סוריה את הנוכחות האירנית, או למצער לצמצמה, שנים של התבססות אירנית עמוקה במוסדות המדינה, בתשתיות אזרחיות ובפרויקטים כלכליים וחברתיים - יקשו עליו מאוד את השלמת המשימה.
ניתן לטעון, שאף התקיפות הישראליות אינן נותנות מענה להתבססות האזרחית ארוכת הטווח של אירן בסוריה, שמעבר ליצירת השפעה ולהפצת השיעה, נועדה בסופו של דבר לתמוך בשאיפות הצבאיות של טהרן בסוריה בפרט וברחבי האזור בכלל. בנוסף, המתקפות האוויריות בסוריה הן טיפה בים. צה"ל משבש במידה מה את העברות כלי הנשק ואת ההתבססות האירנית, אך אין בכוחו לבלום אותן לחלוטין. יש לא מעט משלוחי נשק החומקים מעיני חיל-האוויר הישראלי.