חלק משמעותי מן החקירה עסק בהתערבותו של נתניהו למען מילצ'ן, לאחר שהממשל האמריקני סירב להאריך את ויזת השהייה שלו בארה"ב. נתניהו אישר שפנה לשר החוץ האמריקני דאז, ג'ון קרי, ולשגריר דאז דן שפירו, אך עמד בתוקף על כך שפעל בשל תרומתו של מילצ'ן לביטחון המדינה ולא בשל ידידותם האישית. "יש דברים שהם ממש מקוממים. מי שמכיר אותי יודע, שבנושאים שהם ביטחוניים, כלכליים, מדיניים - אני לא מכניס שום שיקול זר לתוך החדר. ההיכל סגור. איש לא נכנס. לא בשביל חופן סיגרים ולא בשביל כלום", הדגיש נתניהו.
נתניהו אמר לחוקריו, כי מילצ'ן לא סייע למוסד, אלא בנושא אחר (האסור בפרסום) ומצוי באחריותו האישית של ראש הממשלה, ולכן מצא לנכון להתערב. שלטונות ארה"ב סברו, בעקבות ראיון עם מילצ'ן בתוכנית "עובדה", שהוא פגע בביטחון ארה"ב – הסביר נתניהו – ולכן הוא פנה אליהם והבהיר שלא הייתה שום פגיעה כזאת. עוד אמר נתניהו, כי חשש שמילצ'ן ייחקר בארה"ב ויחשוף את סיועו לישראל, וגם בשל כך ביקש לפתור את הבעיה כבר בשלב מוקדם. לדבריו, הוא שוחח בנושא עם שמעון פרס, שהיה מוטרד גם הוא. נתניהו הוסיף, כי סייע בהצלחה גם לראש המטה לביטחון לאומי לשעבר, עוזי ארד, כאשר ארה"ב סירבה להעניק לו ויזה, וגם לראש המוסד לשעבר, מאיר דגן, כאשר נזקק לטיפול רפואי.
החוקרים עימתו את נתניהו עם עדותו של ארי הרו, לשעבר ראש הסגל במשרד ראש הממשלה, ולפיה יום אחד נכנס למעון ראש הממשלה, מילצ'ן הגיע ואמר: "ביבי, שמתי לך את הסיגרים במשרד והבאתי גם שמפניה לשרה" – והפציר בו לשוחח עם קרי בנוגע לוויזה, באומרו שהוא זקוק מאוד לסיועו. נתניהו אמר לחוקרים שאינו זוכר אירוע שכזה ופרץ בצחוק. לדברי נתניהו, הוא לא חשב לרגע שמילצ'ן פונה אליו על-רקע הסיגרים והשמפניות, וכאמור – הוא פעל רק משום שהיה זה אינטרס ישראלי.
חלק משמעותי אחר בחקירה עסק בסיגרים ובשמפניות שקיבלו בני הזוג נתניהו ממילצ'ן, ובשולי הדברים – מג'יימס פאקר. נתניהו דחה לחלוטין את הטחות החוקרים לגבי הכמויות בהן מדובר וטען שלא היה מעורב בצורה כלשהי בשמפניות לרעייתו. נתניהו אמר שאינו זוכר כמה סיגרים ביום עישן; "הרבה", אמר. "עישנתי הרבה ועובדה שהוא [מילצ'ן] נתן לי הרבה סיגרים", אך אין שום קשר בינם לבין הסיוע בוויזה. לדבריו, מילצ'ן היה מביא לפחות בקבוק שמפניה אחד בכל ביקור שלו בבלפור והוא ראה פעם-פעמיים ארגז של בקבוקים – אבל "זה לא אספקה".
לדברי נתניהו, הוא אינו יודע כמה שמפניה שותה רעייתו, הם מתראים בעיקר בשעות הלילה המאוחרות ו"אתה חושב שהיא יושבת שם עם בקבוקי שמפניה? תגידו, אתם נורמליים? מה קורה לכם?", אמר לחוקרים. נתניהו אמר שוב ושוב, כי אינו יודע דבר על כמויות השמפניה עליהן העידו אנשיו של מילצ'ן, אם כי ידע שהיא מקבלת בקבוקים ממילצ'ן. "אשתי אדם עצמאי, אני לא נמצא כל היום, אני מגיע מאוחר בלילה. מה אתה חושב, שיש פה איזה מצעד שמפניות? אין דבר כזה".