שפעת והצטננות הן מחלות דומות שניתן להתבלבל ביניהן.
הצטננות (התקררות, צינון) היא מחלה ויראלית שתסמינה הם: התעטשויות, נזלת, גודש במערות האף, חום (בדרך-כלל לא גבוה), כאבי גרון, שיעול, כאבי ראש ועייפות. זוהי מחלה שכיחה ביותר וניתן להידבק בה מספר פעמים בשנה. הצטננות יכולה לקרות לאורך כל חודשי השנה, אך שכיחותה עולה בחודשי החורף.
שפעת היא מחלה ויראלית חריפה הנגרמת כתוצאה מהדבקה על-ידי וירוס אינפלואנזה A או B. היא מאופיינת בהתפרצויות בעיקר בחודשי החורף. הווירוס מתאפיין בשינויים אנטיגנים מעונה לעונה, כך נוצרים זנים חדשים העמידים לחיסונים הקיימים. עובדה זו מצריכה היערכות שונה בכל חורף. סימני המחלה כוללים בדרך-כלל עליית חום מהירה (מעל 38 מעלות למרות שיש מקרים שחום לא מתפתח), שיעול, כאב גרון, כאב ראש ועייפות, חולשה, כאבי שרירים וכאבי עצמות. השפעת בדרך-כלל נמשכת 7-4 ימים וחולפת מאליה, אך העייפות והחולשה שבעקבותיה עשויות להמשך עוד כשבועיים לאחר שהמחלה כבר נעלמה. המחלה עלולה להיות קשה ולהסתבך לדלקות ריאה (בעיקר) או לדלקת מעטפת הלב.
עד 20% מאוכלוסיית ארה"ב סובלת מתסמיני שפעת עונתית מדי שנה, ויותר מ-200,000 בני אדם מאושפזים עם סיבוכים הקשורים לשפעת. כ-36,000 בני אדם בארה"ב מתים כל שנה כתוצאה מגורמים הקשורים לשפעת.
עונת השפעות היא בלתי צפויה מכמה היבטים: מבחינת תאריך התחלתה; כמה חמורה היא תהא; כמה זמן תמשך ואלו וירוסים יתפשטו. וירוס השפעת H1N1 (שפעת החזירים) בשנת 2009 גרם למגפת השפעת הראשונה מזה 40 שנים. המגיפה לוותה בחוסר ודאות ורמות תחלואה גבוהות מהרגיל של מחלת השפעת שהחלו מוקדם יותר בשנה לעומת רוב עונות השפעת הקודמות.