מותו של יונתן שבר את דודו ומצבו הבריאותי הלך והדרדר. שימחת החיים שלו הפכה לעצב ובמידה רבה, יש האומרים, איבד עניין בחייו. בראיונות לעיתונים המקומיים בירושלים סיפר כי הוא מחכה כבר לרגע שבו יצטרף לבנו יונתן. ב-7 באוגוסט 2017, ארבע שנים לאחר מותו של בנו האהוב מת דודו קופרמן ("דודו ראש העיר"), יש אומרים משברון לב, והוא בן 75 במותו.
העיתונאי והסופר שוקי בן-עמי איש ירושלים מנחה תוכנית הרדיו 'הפרלמנט הירושלמי' ברדיו ירושלים, שהיה חברו של דודו במשך שנים רבות מספר: "דודו היה מלך חיי הלילה של ירושלים, כשעוד לא היו כאן לילות ולא היו כאן חיים...
חברותנו התפרסה על פני 5 עשורים. הוא ריתק בסיפוריו, וכמו כל סיפור טוב, גם סיפוריו לא ממש תאמו למציאות. "אני מספר סיפורים, לא היסטוריון..." נהג לומר. דודו ידע לצחוק וידע לבכות. וכשהוא נשבר אחרי מות בנו היחיד יהונתן, הוא התרסק לרסיסים.
הוא היה איש רעים להתרועע. הכיר את כולם וכולם הכירו אותו. כאשר אנחנו הלכנו והזדקנו, דודו נשאר חבר עם הדורות הצעירים. הוא יצר שפה משלו עם ביטויים משלו, רבים מהם נמצאים במדורים השבועיים במקומונים בהם כיכב. אהבתי אותו. הוא חסר לי בכל יום ויום".
ב-28 ביוני 2021, נחנך בטקס מיוחד ספסל לזכרו של דודו קופרמן ("דודו ראש העיר") ברחוב הפלמ"ח בשכונת קטמון מול בית קפה בו נהג לשבת בשנותיו האחרונות. על הספסל נקבע שלט הנצחה לזכרו. הטקס נערך במעמד ראש העירייה משה ליאון, אלמנתו של דודו נעמי ארליך-קופרמן, בני משפחתו חבריו ומכריו.